ИСТИНА

В процессе транскрипции происходят запрограммированные в ДНК остановки синтеза РНК – транскрипционные паузы, которые выполняют регуляторные функции. Важной разновидностью транскрипционных пауз в клетках бактерий являются сигма-зависимые паузы, при которых сигма-субъединица РНК-полимеразы (РНКП) опознаёт промотор-подобные участки в транскрибируемой ДНК. До сих пор о такой способности было известно только для главной сигма-субъединицы Escherichia coli – сигма70. Однако, в клетках E. coli присутствует ещё 5 альтернативных сигма-субъединиц, родственных сигма70-субъединице. Способны ли они вызывать такие паузы, не известно. Целью данной работы является выявление и исследование свойств пауз, вызванных альтернативными сигма-субъединицами. Нами установлено, что сигма38-субъединица, ответственная за транскрипцию генов в стационарной фазе роста и в стрессовых условиях, способна с высокой эффективностью вызывать паузу в модельных элонгационных комплексах, содержащих последовательность -10 элемента промотора. Показано, что при мутациях в -10-подобном элементе пауза исчезает. Изучены особенности структуры элонгационного комплекса при связывании сигма38-субъединицы. Установлено, что сигма38-зависимая пауза ослабляется в присутствии факторов GreA и GreB, которые активируют расщепление РНК в активном центре РНКП. Это указывает на то, что в состоянии паузы комплекс смещается назад по матрице ДНК, что приводит к остановке транскрипции. Дальнейшей задачей работы является изучение возможной роли сигма38-зависимых пауз в регуляции транскрипции генов, а также анализ формирования пауз с участием других альтернативных сигма-субъединиц. Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ № 15-34-20928.