ИСТИНА

Аптамеры - короткие синтетические ДНК или РНК олигонуклеотиды (до 50 нуклеотидов), способные специфично связываться с белками. Сеqчаc существует метод, позволяющий искать аптамеры in vitro, но он имеет ряд недостатков, главным из которых является большая недопредставленность последовательностей, что влечёт за собой потерю возможно более удачных вариантов. Поэтмоу было решено разработать некомбинаторный метод, который позволит искать последовательности нуклеиновых кислот, способных связываться с заданным белком in silico. На данный момент были разработаны алгоритмы поиска области контакта аптамера с белком, нахождение мест связываний азотистых оснований с белком и поиск наиболее энергетически-выгодных оснований для связывания в найденных местах.