ИСТИНА

Роторная мембранная АТФ-синтаза является одним из самых больших, сложно устро- енных и регулируемых ферментов. Данный фермент катализирует перевод друг в друга основных энергетических валют клетки: электрохимического потенциала и АТФ. Одним из способов регулирования работы фермента у некоторых организмов является его ин- гибирование магниевым комплексом АДФ [2]. Полный механизм этого процесса на дан- ный момент доподлинно не определен. Кроме этого биоинформатическими методами было предсказано существование подсемейства АТФ-синтаз F-типа: N-АТФаз [1], коррелирую- щие мутации в субъединицах которых требуют отдельного изучения. Для анализа использованы все доступные прокариотические полные геномы, по кото- рым произведен поиск последовательностей некоторых субъединиц роторной мембранной АТФ-синтазы F-типа. На основе найденных и отобранных последовательностей построе- ны множественные выравнивания, которые были потом исправлены и улучшены вручную. Выравнивания использовались для поисков коррелирующих мутаций при помощи CMAT [3]. В ходе работы выявлены коррелирующие мутации как внутри исследованных субъ- единиц, так и между ними. Всего было предсказано более 50 значимых (p-value < 0.01) потенциальных коррелирующих мутаций в каждом типе рассматриваемых субъединиц: альфа-субъединице, бета-субъединице и гамма-субъединице. По 20 предсказанных коррелирующих мутаций отобрано для детального рассмотрения для каждой субъединицы. На основе полученных данных планируется дальнейшее изучение влияния точечных мутаций в найденных позициях на функционирование и регуляцию фермента. Источники и литература: 1) Dibrova, D.V, Galperin, M.Y., and Mulkidjanian, A.Y. Characterization of the N-ATPase, a distinct, laterally transferred Na+-translocating form of the bacterial F-type membrane ATPase. // Bioinformatics 26, 12 (2010), 1473–1476. 2) Hyndman, D.J., Milgrom, Y.M., Bramhall, E. A., and Cross, R.L. Nucleotide-binding sites on Escherichia coli F1-ATPase: Specificity of noncatalytic sites and inhibition at catalytic sites by MgADP. // Journal of Biological Chemistry 269, 46 (1994), 28871–28877. 3) Jeong, C.S. and Kim, D. Reliable and robust detection of coevolving protein residues. // Protein Engineering, Design and Selection 25, 11 (2012), 705–713. Слова благодарности: Выражаю благодарность своим научным руководителям: к.б.н. Д.В. Дибровой (НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ) и д.б.н. А.Я. Мулкиджаняну (НИИ ФХБ имени А.Н. Бе- лозерского МГУ).