ИСТИНА

Проведено моделирование миграции энергии возбуждения в пигмент-белковом комплексе фотосистемы 1 (ФС-1) цианобактерий. Расчеты выполнены для мономерной и тримерной форм ФС-1. Пространственная структура мономера ФС-1 была взята из базы данных белков (Protein Data Bank http://www.rcsb.org/pdb). На основе структуры мономера были проанализированы некоторые варианты формирования тримера ФС-1. Для мономера и тримера рассчитаны экситонные структуры возбужденных состояний. На основе моделирования спектров оптического поглощения, кругового и линейного дихроизма, а также кинетических кривых «накачки-зондирования» были вычислены энергии взаимодействия между молекулами хлорофилла внутри прицентрового комплекса, периферических антенных комплексов Lhca и Psa. Энергии Qy перехода мономерных хлорофиллов были оценены с помощью метода дифференциальной эволюции, являющегося разновидностью генетических алгоритмов поиска оптимальных решений. Процедуры были распараллелены с использованием библиотеки MPI. Вычисления проводились на суперкомпьютере «Ломоносов» МГУ. В результате анализа теоретических данных были идентифицированы группы молекул хлорофилла, которые соответствуют возбужденным состояниям с энергиями меньше энергии реакционного центра Р700 («зацентровые» формы хлорофилла). Расчетные данные сравниваются с полученными нами ранее экспериментальными данными для цианобактерии Arthrospira platensis [ 1 ]. Литература 1. Kompanets V. et al. Red chlorophyll excitation dynamics in Arthrospira platensis photosystem I trimeric complexes as studied by femtosecond transient absorption spectroscopy // FEBS Letters Vol. 588, No. 35, 2014, Pp. 341-344.