ИСТИНА

Нуклеосомы являются основными образующими элементами хроматина. Они состоят из гистоновых белков с участком молекулы ДНК и способствуют не только компактиза- ции последней внутри ядра, но также играет важную роль в процессах транскрипции и репарации. Специальные белковые комплексы ремоделеры осуществляют перемещение и изменение состава нуклеосом. Недавно было показано, что гистоновый октамер пре- терпевает внутренние конформационные изменения, которые изменяют структуру всей нуклеосомы и позволяют ей взаимодействовать с различными белковыми комплексами, а также напрямую влияют на транслокацию ДНК [2]. В связи с этим актуальным является понимание внутренней динамики гистонового октамера, в частности димеров гистонов H3-H4, на молекулярном уровне. Такого рода пластичность с трудом изучается экспери- ментально, поэтому были использованы методы молекулярной динамики [1]. С использованием методов молекулярной динамики и молекулярного моделирования был решен ряд задач: 1) проведена молекулярная динамика полноатомных моделей ди- мера H3-H4; 2) создана полноатомная модель нуклеосомы со сшивками между гистонами H3-H4; 3) изучено влияние дисульфидных сшивок на динамику димера гистонов H3-H4. Работа была выполнена с использованием оборудования Центра коллективного пользо- вания сверхвысокопроизводительными вычислительными ресурсами МГУ имени М.В. Ломоносова. Работа поддержана грантом РНФ No 18-74-10006.