ИСТИНА

Представлены первые результаты разработки ингибиторов белка YB-1. Цель – воздействовать на домен холодового шока этого белка. В медицинской практике еще нет лекарств на основе таких ингибиторов. Разработана молекулярная модель возможного центра связывания, при котором будет блокирован перенос YB-1 в ядро клетки – важный процесс с точки зрения развития опухоли. Модель содержит несколько возможных структур, так как рассматриваемый домен белка YB-1 обладает заметной подвижностью. Проведена оценка связывания с этим центром некоторых известных или потенциальных ингибиторов. Методика: сначала проводится докинг с помощью программы докинга SOL, а затем лучшее место связывания используется в качестве начальной конформации лиганда для проведения расчета энтальпии связывания: оптимизация по атомам лиганда с квантовохимическом полуэмпирическом методе PM7 с учетом растворителя в континуальной модели COSMO. Проведен виртуальный скрининг базы данных готовых соединений кафедры органического синтеза Воронежского государственного университета (ВГУ) – более 15 000 соединений. По результатам расчетов отобраны 13 наиболее лучших кандидатов. Эксперименты на клеточных культурах показали цитотоксичность к раковым клеткам у двух из этих 13 соединений, причем одно из них имеет цитотоксичность на уровне 5 мкм и высокую избирательность, т.е. не обладает цитотоксичностью на здоровых клетках. Проводятся работы по уточнению молекулярного механизма действия найденного вещества.