ИСТИНА

Исследование распределения рибосомных белков среди различных таксономических групп живых организмов и выявления специфических признаков между ними и внутри каждой группы актуально для понимания эволюции белковых компонент рибосомы [1]. Семейство рибосомных белков S1 является уникальным белковым семейством, поскольку число структурных доменов в нем изменяется в строго ограниченном диапазоне: от одного до шести [2]. S1 белки связываются с мРНК, вовлечены в процессы инициации и трансляции in vivo, а также взаимодействуют с мРНК-подобной частью молекулы тмРНК [3]. Реализация алгоритма автоматического поиска и извлечения данных о доступных записях белка S1 в базе UniProt позволила сформировать выборку, содержащую 1453 белковых последовательностей. Анализ выборки показал, что рибосомный белок S1 идентифицируется в 25 различных бактериальных отделах. Кроме того, существует корреляция между числом структурных доменов и таксономическим бактериальным отделом. Например, 62% всех записей определяются как шестидоменные белки S1, и, в основном, относятся к отделу Proteobacteria. Четырехдоменные белки S1 преобладают в отделах Firmicutes и Actinobacteria. Записи, относящиеся к этим отделам, составляют 33% от всей исследуемой выборки. Наименее представленные двухдоменные S1 белки (0,6%). Таким образом, число структурных доменов в рибосомных белках S1 можно рассматривать как дополнительный уникальный признак для систематики основных бактериальных отделов. Отметим, что полученные результаты отличаются от данных, полученных на небольших выборках белков данного семейства [4], и должны рассматриваться как более точные. Дальнейшее исследование полученных данных позволит найти подтверждение одной из предложенных теорий эволюционного развития белков со структурными повторами: от многодоменных белков к однодоменным или обратно [5]. Работа поддержана грантом РНФ № 18-14-00321. Примечание: Мы благодарны нашему руководителю д.ф.-м.н. Галзитской О.В.