![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Исследование белков является одной из важных современных задач биологии. При решении многих задач биоинформатики возникает необходимость по заданной структуре белка определить структурно схожие с этим белком известные белки. Поиск схожих по трехмерной структуре известных белков помогает понять функции белка. В работе предлагается нейросетевой метод сранительного анализа структур заданнной пары белков. Предложенный метод позволяет быстро отобрать в базе данных структур потенциально схожие по структурам белки. В работе обсуждаются архитектура и параметры предложенной нейросети и предлагается метод выделения признаков рассматриваемых структур. Обучение нейросети предлагается проводить с использованием имеющихся баз данных с выделенными доменами структурно похожих белков. В качестве решения для обучения нейросети предлагается использовать базу данных доменов CATH S40. Рассматривается метод перевода трехмерной структуры белка в вектор признаков при помощи анализа расстояний между парами центральных атомов аминокислот. Предлагается несколько вариантов предложенного подхода. Приводятся результаты экспериментального исследования разработанного метода.