ИСТИНА

Газовая хроматография с масс-спектрометрическим детектированием является одним из самых эффективных методов идентификации и определения компонентов сложных смесей летучих и термостабильных органических соединений. Сырые ГХ/МС данные сначала регистрируют при использовании программного обеспечения, поставляемого с прибором. Перед проведением поиска по базам данных значения m/z в экспериментальных масс-спектрах низкого разрешения, представленные, как правило, в формате чисел с плавающей точкой, округляются автоматически до целых. Округление различными программами проводится по разным алгоритмам и может приводить к различным результатам (масс-спектры, отвечающие одному времени удерживания, могут совпадать не полностью). Такие различия в масс-спектрах, обусловленные округлением, могут влиять на результаты идентификации соединений. В данной работе выяснили, какие правила округления используются в ряде популярных программ, предназначенных для обработки ГХ/МС данных, а также предложили оптимальное правило округления, проанализировав плотность распределения числа возможных фрагментных ионов в зависимости от значения m/z. Для построения этого распределения использовали два набора модельных данных: для формирования первого набора рассчитали все теоретически возможные фрагменты для органических соединений из базы данных NIST’17 с молекулярной массой менее 800 Да; для второго – использовали реально существующие органические вещества, представленные в базе данных PubChem с массой до 600 Да. Общее число рассмотренных брутто-формул ионов для первого набора составило 14.3 млн, а для второго – 1.5 млн (все со значением m/z <600 Да). Алгоритмы округления сравнили, оценив число случаев, когда получаемое целочисленное значение зависит только от случайных приборных погрешностей. Из числа рассмотренных программ наилучшие результаты были получены для AMDIS. Учитывая высокую популярность AMDIS, этот алгоритм округления можно рекомендовать к использованию в других программных продуктах, что обеспечит идентичность получаемых результатов. Другим возможным решением проблемы округления может быть отказ от округления до целочисленных значений m/z в масс-спектрах низкого разрешения.