ИСТИНА

Нарушение сахарофосфатного остова ДНК – одно из наиболее часто возникающих в клетке повреждений. Разрыв матричной цепи in vitro вызывает остановку транскрибирующей РНК-полимеразы (РНКП), однако такого не наблюдается при нарушениях комплементарной цепи. Ранее в экспериментальной системе in vitro было показано, что однонитевой разрыв (ник) нематричной цепи также может вызывать остановку РНКП, но только при организации ДНК в нуклеосому (1). Места остановки фермента расположены после повреждения и имеют выраженную 10-пн периодичность, а эффективность зависит от положения разрыва относительно места остановки. Для объяснения наблюдаемого эффекта была предложена модель механизма элонгации через хроматин с образованием внутринуклеосомных петель – интермедиатов, в которых фермент оказывается остановленным в петле ДНК на гистоновом октамере (1, 2). Согласно модели, разрыв цепи уменьшает вызываемое транскрипцией напряжение в структуре ДНК и замедляет раскрытие петли и дальнейшую элонгацию. В данной работе определены границы таких петель. Для этого получены нуклеосомы с различным расположением однонитевых разрывов нематричной цепи, и проведена их транскрипция in vitro. Определено, что образование контактов ДНК и гистонов позади РНКП происходит примерно на расстоянии 20 п.н. Остановка РНК-полимеразы в клетках может приводить к активации системы репарации. Поэтому мы предполагаем, что обнаруженный эффект в живых организмах может приводить к ускорению репарации разрывов некодирующей цепи ДНК, которые в других случаях могут оставаться незаметными для системы репарации из-за взаимодействия с гистонами.