ИСТИНА

В работе исследуются случайные находки патогенных и вероятно патогенных вариантов 28 генов, ассоциированных с онкологическими синдромами, у населения Российской Федерации. В анализ вошли результаты полногеномного секвенирования 74996 человек из 52 регионов РФ и 2872 долгожителя (90 и более лет). Данные для рекомендованных ACMG (3 версия, 2021 год) 28 генов, были проаннотированы при помощи InterVar (v.27.07.21), сохранены экзонные несинонимичные замены, вставки/делеции участков экзонов и сайтов сплайсинга. Полученные варианты были разделены на группы по интерпретации в ClinVar, большинство были перепроверены экспертами вручную с использованием данных литературы. Среди 74996 человек мы сообщаем о 279 патогенных (П) и вероятно патогенных (ВП) вариантах (232 П и 46 ВП) и 216 ожидаемо патогенных (ОП) вариантов неопределенного значения (из них 175 вариантов обнаружены de novo). Наиболее распространенной оказалась замена rs36053993 (ВП) гена MUTYH (AF – 0.0052). У 1365 (1.82%) участников имелись П или ВП варианты генов APC, BMPR1A, BRCA1,BRCA2, MEN1, MLH1, MSH2, MSH6, MUTYH, NF2, PALB2, PMS2, PTEN, RET, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SMAD4, TMEM127, TP53, TSC1, TSC2, VHL, WT1, большинство носителей из Москвы или МО. Среди 2872 долгожителей – 21 П и ВП, 16 ОП вариантов, П и ВП варианты встречались у 55 (1.98%) участников в генах SDHD, TP53, BRCA1, BRCA2, MUTYH, PALB2, PMS2, SDHB. Это исследование позволяет оценить бремя наследственных мутаций, ассоциированных с развитием злокачественных новообразований среди населения РФ, а также особенности географии и миграционных процессов, которые могут стать основанием для разработки новых подходов в области генетического скрининга и первичной профилактики онкологических заболеваний РФ.