![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
В данной работе предпринята попытка оценить информативность и удобство использования в качестве ДНК-баркодов нескольких традиционно применявшихся в этой роли маркеров для переднеазиатской группы видов рода Gladiolus. Для этого были взяты образцы трёх достаточно близких, но хорошо различающихся морфологически и экологически видов рода с переднеазиатскими ареалами (G.atroviolaceus, G.kotschyanus, G.szovitsii) из гербариев MW, ERE и полевых сборов автора: в качестве внешней группы были взяты последовательности для европейского вида G.communis из ГенБанка. Наиболее мономорфной, не позволяющей различить виды, оказалась частичная последовательность гена rbcL, т.н. rbcL-a. Пять вариабельных локусов маркера matK (праймеры Kim) группируют образцы отдельных видов вместе, при этом различая виды между собой. Наконец, маркер trnL-F (объединенные последовательности trnL-интрона и trnL-trnF межгенного спейсера) позволяет не только различить виды, но и обнаружить некоторый внутривидовой полиморфизм для образцов широкоареального G.atroviolaceus из различных локаций. Обладая на порядок большей информативностью, популярные баркоды ITS оказались мало пригодны для баркодирования гладиолусов из-за низкой специфичности стандартных праймеров. Так как исходные образцы почти всегда контаминированы ДНК грибов, получение чистых целевых ПЦР-продуктов оказывается затруднено.