ИСТИНА

Методы ЯМР позволяют детектировать связывание и изучать взаимодействие белок-лиганд в широком диапазоне констант диссоциации лигандов. На основе этих возможностей в последнее десятилетие быстрыми темпами стали развиваться методы ЯМР-скрининга физиологически активных соединений. В сообщении представлены результаты применения современных методик ЯМР скрининга для поиска ингибиторов метионин гамма-лиазы – фермента, участвующего в катаболизме метионина и цистеина у ряда бактерий и простейших эукариот, включая патогенные микроорганизмы. Его отсутствие у млекопитающих позволяет рассматривать этот фермент в качестве перспективной мишени для дизайна потенциальных антибактериальных препаратов. В настоящее время в медицинской практике отсутствуют препараты, основанные на ингибировании активности метионин гамма-лиазы. Работа включала этап виртуального скрининга библиотеки коммерчески доступных соединений in silico и последующий экспериментальный отбор соединений-лидеров, способных взаимодействовать с ферментом. Идентификация связывания проводилась с помощью методов разностной спектроскопии на переносе насыщения (STD) и WaterLOGSY. Для двух соединений-лидеров с помощью метода WaterLOGSY определены константы связывания с ферментом. Проведенное исследование расширяет структурную группу потенциальных ингибиторов метионин гамма-лиазы и позволяет перейти к дизайну соединений, обладающих более высокой ингибирующей активностью. В сообщении представлены также перспективы развития методов спектроскопии ЯМР для совершенствования подходов к дизайну новых физиологически активных соединений. Работа выполнена за счет гранта Российского Научного фонда (14-14-00598) с использованием ресурсов суперкомпьютерного комплекса МГУ имени М.В.Ломоносова.