|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Изучение молекулярных механизмов ионной проводимости бактериального калиевого канала KcsA методами молекулярного моделированиядипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Шайтан А.К.
- Автор: Касимова М.А.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2011
- Аннотация: Работа посвящена изучению процесса проведения ионов калия калиевым каналом с помощью методов молекулярного моделирования. Проводится обзор литературных данных по объекту изучения, бактериальному калиевому каналу KcsA. Описываются теоретические основы компьютерного молекулярного моделирования в рамках классических силовых полей, приведено описание метода оценки свободной энергии системы. Практическая часть работы состоит в применении классического метода молекулярной динамики к изучению процесса проведения ионов через канал. Процесс проведения ионов был смоделирован при различных внешних условиях: различном значении напряженности электрического поля и различном значении концентрации калиевой соли в воде. На основе траекторий молекулярной динамики были построены вольтамперные характеристики KcsA. Были выявлены два механизма проведения ионов калия через ионный канал. С помощью метода Adaptive biasing force были рассчитаны профили свободной энергии для одного иона в канале и для триплета ионов, находящихся в селективном фильтре, при различных условиях напряженности внешнего поля.
- Добавил в систему: Шайтан Алексей Константинович