Поиск микроРНК, вовлеченных в гетерогенность МСК в профибротических условиях, с помощью биоинформатического анализа данных транскриптома единичных клетокдипломная работа (Специалист)
Аннотация:Фиброз — это физиологический процесс, развивающийся в исходе ранозаживления и характеризующийся заменой паренхимы соединительной тканью, что в случае патологического прогрессирования приводит к потере функции ткани и органной недостаточности. Развитие фиброза связано с повышенным уровнем дифференцировки миофибробластов из клеток мезенхимального происхождения, в результате чего происходит чрезмерная выработка компонентов внеклеточного матрикса, включая коллаген и фибронектин. Элиминация миофибробластов путем апоптоза или дедифференцировки необходима для регрессии фиброза и физиологического ремоделирования ткани в процессе заживления.
Накопленные экспериментальные данные показывают, что мультипотентные мезенхимальные стромальные клетки (МСК) могут играть неоднозначную роль в развитии фиброза: часть МСК пополняют пул миофибробластов, способствуя прогрессированию фибротических изменений, однако другие субпопуляции МСК могут подавлять фиброз, в частности за счет антифибротических эффектов компонентов секретома этих клеток, включая перенос некодирующих РНК. Среди некодирующих РНК лучше всего изучен подкласс микроРНК (миРНК), которые контролируют экспрессию генов путем её подавления на посттранскрипционном уровне и, таким образом, могут вносить вклад в регуляцию дифференцировки миофибробластов, что делает их перспективными мишенями для использования в лечении фиброза. Однако, остается неизвестным, действительно ли в популяции МСК присутствуют клетки, по-разному отвечающие на медиаторы фиброза и формирующие как субпопуляции дифференцирующихся миофибробластов, так и стромальных клеток, способных подавлять развитие фиброза, а также какова роль различий в паттернах экспрессии миРНК в этих процессах.
Цель данной работы - оценить гетерогенность ответа МСК человека in vitro на профибротические стимулы с помощью анализа транскриптома единичных клеток и выявить миРНК, которые могут вносить наибольший вклад в развитие антифибротического фенотипа определенных субпопуляций МСК.