|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Поиск клеточных белков, участвующих в IRES-зависимой инициации трансляции, методом полногеномного CRISPR/Cas9-опосредованного скринингадипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Дмитриев С.Е., Кущенко А.С.
- Автор: Конопатов А.В.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: Первый московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова
- Год защиты: 2022
- Аннотация: Канонический путь инициации трансляции у эукариот представляет собой комплексный процесс, требующий участия большого количества белковых факторов. Вирусы, не имея полного набора компонентов трансляционного аппарата, используют систему биосинтеза белка клетки-хозяина. При этом они вынуждены конкурировать с клеточными мРНК, зачастую используя неканонические механизмы инициации трансляции. Например, некоторые вирусные мРНК содержат особые структурные элементы, так называемые внутренние сайты посадки рибосом (IRES), которые способны привлекать рибосому непосредственно на внутренние стартовые кодоны мРНК независимо от 5’-концевого m7G-кэпа. Несмотря на многочисленные исследования IRES и их широкое использование в генно-инженерных конструкциях, до сих пор нет исчерпывающего понимания механизма работы этих элементов, в том числе информации о полном наборе клеточных белковых факторов, необходимых для их эффективного функционирования. В связи с этим актуальной задачей является идентификация белков, принимающих участие в IRES-зависимой инициации трансляции, с применением методов системной биологии (в частности, генетического скрининга), что не только интересно с точки зрения фундаментальной науки, но и будет полезно для разработки новых противовирусных препаратов. Данная работа имеет две цели: (1) создание клеточных линий для проведения на них полногеномного CRISPR/Cas9-опосредованного скрининга с целью выявить гены, продукты которых участвуют в IRES-зависимой инициации трансляции; (2) верификация результатов проделанного ранее CRISPR-скрининга, направленного на поиск генов, нокаут которых делает клетки устойчивыми к штамму Zfmut вируса энцефаломиокардита (EMCV).
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич