|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Поиск новых низкомолекулярных ингибиторов биосинтеза белка, селективно связывающихся в Е-сайте бактериальной рибосомыдипломная работа (Специалист)
- Научные руководители: Манцызов А.Б., Польшаков В.И.
- Автор: Лаптев Г.Ю.
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2017
- Аннотация: Дипломная работа Лаптева Г.Ю. посвящена поиску ингибиторов бактериальной рибосомы методами виртуального скрининга. Развитие резистентности к антибиотикам ведет к увеличению смертности от инфекционных заболеваний. Таким образом, разработка новых антибактериальных препаратов является актуальной проблемой современной медицинской химии и фармакологии. В качестве мишеней для связывания лигандов в дипломной работе были рассмотрены два участка Е-сайта: участок в области мРНК-тоннеля и участок в области связывания ССА 3’-конца тРНК. Селективные ингибиторы бактериальной рибосомы, связывающиеся в этих фрагментах Е-сайта, на данный момент неизвестны. В итоге проведенной работы на системах, для которых была известна трехмерная структура комплексов ингибиторов с рибосомой, проведена отработка методов докинга и оптимизация условий расчетов для наиболее точного воспроизведения экспериментальных результатов. Разработан алгоритм докинга лигандов, содержащих в своем составе конформационно гибкие циклические структуры. Выявлены структурные различия в Е-сайтах бактериальной и эукариотической рибосом, которые представляются важными для поиска селективных ингибиторов. На основании полученных данных отобраны соединения, образующие специфические контакты с бактериальной рибосомой в расчетных моделях комплексов и имеющие наилучшие в сравнении с известными лигандами значения оценочных функций.
- Добавил в систему: Манцызов Алексей Борисович