|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Моделирование взаимодействия белок-лиганд в присутствии растворителядипломная работа (Магистр)
- Научный руководитель: Сулимов Владимир Борисович
- Автор: Бувалый Семён Евгеньевич
- Тип: Магистр
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова, Физический Факультет МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2017
- Аннотация: В рамках данной работы представлен алгоритм параметризации неявных моделей растворителя для трех методов расчета полярной составляющей энергии сольватации. Для реализации этого алгоритма написана программа многопараметрической локальной минимизации с использованием параллельных вычислений. Программа прошла валидацию и может быть использована для решения широкого круга задач. Проведена параметризация для двух методов на двух наборах незаряженных малых молекул. Выполнено сравнение экспериментальных результатов и результатов расчета различными методами, а также самих методов между собой. Кроме того, рассчитаны значения энергии десольватации для нескольких комплексов белок-лиганд, включающих урокиназу и фактор свертывания FXa.
- Добавил в систему: Сулимов Владимир Борисович