Синтез и изучение свойств модифицированных олигонуклеотидов, содержащих нуклеотидный фрагмент с βдикетогруппой при С2’-атомедипломная работа (Специалист)
Аннотация:Химические методы присоединения белков к НК основаны на селективном введении в состав белка или НК реакционноспособных группировок. Настоящая работа посвящена конструированию реагента, направленно взаимодействующего с остатком аргинина в участке специфического связывания белка с нуклеиновой кислотой: синтезу и изучению свойств нового класса соединений – олигонуклеотидов, содержащих нуклеотидный фрагмент с β-дикетогруппой при С2’-атоме. Предполагается, что β-дикетогруппа такого ДНК-лиганда способна селективно взаимодействовать с пространственно сближенной гуанидиновой группировкой боковой цепи аргинина. Определена термическая устойчивость полученных модифицированных ДНК-дуплексов. Для подбора оптимальных условий проведения аффинной модификации аргинина было изучено взаимодействие олигонуклеотидов, содержащих β-дикетогруппу, с модельными соединениями: гуанидином и производными аргинина. Проведены эксперименты по ковалентному связыванию модифицированных ДНК-дуплексов с большой субъединицей эндонуклеазы рестрикции BspD6I (никазой BspD6I). В обзоре литературы обобщены данные о реагентах для модификации остатков аргинина в белках.