|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Деконструкция механизмов старения и долголетия с помощью генных сетейкурсовая работа (Специалист)
- Научные руководители: Дмитриев С.Е., Тышковский А.Э.
- Автор: Холдина Дарья Александровна
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Кафедра: Факультет биоинженерии и биоинформатики
- Год защиты: 2024
- Курс: 4
- Аннотация: В области исследования старения за последние годы наблюдаются значительные достижения, такие как разработка количественных молекулярных биомаркеров биологического возраста и продолжительности жизни [1,2], а также открытие различных интервенций, способных увеличить продолжительность жизни млекопитающих [3,4], приводя к замедлению установленных признаков старения [5]. Хотя молекулярные инструменты, такие как эпигенетические часы, продемонстрировали свою способность предсказывать возраст и смертность, всестороннее понимание точных механизмов, лежащих в основе этих предсказаний, остается туманным. Чтобы создать более интерпретируемую альтернативу традиционным эпигенетическим часам, наша лаборатория недавно разработала транскриптомные часы. Эти модели предсказывают биологический возраст и ожидаемую смертность млекопитающих, используя данные об экспрессии генов из более чем 4 500 образцов, собранных из 26 тканей мышей и крыс разного возраста и пола, а также животных, подвергшихся различным вмешательствам, изменяющим продолжительность жизни, таким как прогерия, ограничение калорийности и рапамицин. В данной работе мы использовали этот набор данных и применили метод взвешенного анализа сети ко-экспрессии генов (WGCNA) для выявления кластеров ко-регулируемых генов, ассоциированных с хронологическим возрастом, смертностью и продолжительностью жизни. Наш анализ выявил более 20 модулей генов, которые в значительной степени коррелируют со старением и смертностью, а также связаны с отдельными функциональными процессами клетки. Так, среди них были обнаружены модули, которые участвуют в воспалительной реакции, интерфероновом ответе, клеточном дыхании, липидном обмене, клеточном цикле и организации внеклеточного матрикса. Используя выявленные подмножества ко-регулируемых генов, мы построили часы хронологического возраста, смертности и продолжительности жизни для отдельных компонентов транскриптома и применили их для характеристики молекулярных механизмов, ответственных за про- или антивозрастной эффект различных возраст-зависимых заболеваний мышей. Таким образом, сетевой анализ позволил нам дополнить транскриптомные часы поддающимися интерпретации инструментами, способными оценить влияние интервенций на конкретные клеточные пути, связанные со старением и долголетием. В дополнение к углублению нашего понимания механизмов старения, эти инструменты могут способствовать разработке новых мер по продлению жизни, направленных на устранение конкретных признаков старения, а также прогнозированию оптимальных комбинаций геропротекторов, которые бы синергетично воздействовали на несколько этапов старения.
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич