Аннотация:Белок Ku – эволюционно консервативный среди эукариот гетеродимер, принимающий участие во многих клеточных процессах на каждой из стадий клеточного цикла [1]. Он обладает высокой аффинностью к свободным концам двуцепочечной ДНК вне зависимости от нуклеотидной последовательности [2], такое взаимодействие достаточно хорошо изучено и описано. Отдельно необходимо упомянуть, что Ku влияет на транскрипцию с промотора ВИЧ-1, однако механизм этого влияния до сих пор не выяснен [7]. При этом известно, что in vitro человеческий Ku взаимодействует с TAR РНК (trans-activation responsive element) вируса иммунодефицита человека (ВИЧ-1) [9]. Детальное исследование взаимодействия Ku c TAR РНК, возможно, позволит понять механизм Ku-опосредованной регуляции транскрипции ВИЧ-1. В свою очередь это поможет разработать более эффективную терапию для больных синдромом приобретенного иммунодефицита человека (СПИДом).
В настоящей работе была поставлена задача провести систематическое исследование взаимодействия человеческого Ku c РНК. Была изучена эффективность образования комплексов человеческого Ku, экспрессированного и очищенного из E. coli, с различными структурами РНК in vitro. Полученные данные призваны помочь определить, с каким структурным элементом РНК связывание Ku будет наиболее прочным, какой фрагмент TAR РНК наиболее важен для взаимодействия с Ku. Таким образом, целью данной работы стало выяснение структурных детерминантов в РНК, важных для взаимодействия с человеческим Ku. Работа включает обзор литературы, посвященный изучаемому предмету.