![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Диссертация посвящена изучению конформационных и динамических свойств топологически стабилизированных полимерных состояний. В первой оригинальной главе диссертации предлагается гауссова модель полимерных цепей, в рамках которой вводятся эффективные квадратичные взаимодействия для каждой пары мономерных звеньев. Показано, что полимерным состояниям с фиксированной фрактальной размерностью, таким как сколлапсированное незаузленное полимерное кольцо и конформация хроматина (материала хромосом) на промежуточных масштабах, соответствуют алгебраически спадающие константы жесткости взаимодействий. Найдена связь между показателем спадания констант взаимодействий и равновесной фрактальной размерностью цепи. Во второй оригинальной главе изучается динамика топологических полимерных состояний с помощью эффективного гамильтониана, разработанного в первой главе. Мы предлагаем обобщенную модель Рауза, описывающую динамику мономерного звена цепи с произвольной фрактальной размерностью в среде с вязкоупругими свойствами, такой как цитоплазма бактерий и нуклеоплазма эукариот. Наши результаты объясняют имеющиеся в литературе экспериментальные данные по среднеквадратичным смещениям локусов хроматина в различных клетках. Для определения как фрактальной размерности хроматина, так и параметра вязкоупругости окружающей среды из экспериментов по динамике хроматина, мы предлагаем измерение двухточечной автокорреляционной функции парного расстояния между локусами и находим явный вид этих функций для рассматриваемой модели. В третьей оригинальной главе мы исследуем вероятности многочастичных контактов во фрактальных полимерных цепях в рамках гауссовой модели. Эти результаты могут быть использованы для осмысления и систематизации появляющихся данных по статистике тройных контактов в хроматине и определения его фрактальной размерности. Кроме того, мы изучаем связь пространственной иерархии полимерной конформации и иерархии в тонкой структуре карт контактов этой конформации на примере задачи о коллапсе гомополимерной цепи с необратимым сшиванием звеньев. В рамках данного вопроса мы предлагаем метод выявления кластеров в разреженных картах контактов индивидуальных конформаций и исследуем связь теоретико-числовых особенностей таких карт с биологически релевантным сигналом.
№ | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
---|---|---|---|---|---|
1. | Сведения о научном руководителе | Nauch_ruk_Tamm.pdf | 35,4 КБ | 3 июня 2019 | |
2. | Решение дисс.совета о приеме/отказе к защите | Protokol_priema_Polovnikov.pdf | 88,1 КБ | 3 июня 2019 | |
3. | Полный текст диссертации | dissertation2.pdf | 7,0 МБ | 31 мая 2019 | |
4. | Сведения об официальных оппонентах, включая публикации | Sved_ob_op_ISTINA.pdf | 105,6 КБ | 4 июня 2019 | |
5. | Отзыв на автореферат | Otz_Polotskij_scan.pdf | 1,4 МБ | 10 октября 2019 | |
6. | Заключение диссертационного совета по диссертации | Zaklyuchenie_soveta_Polovnikov.pdf | 103,1 КБ | 17 октября 2019 | |
7. | Отзыв официального оппонента | otzyiv_Borisov_ISTINA.pdf | 4,1 МБ | 7 октября 2019 | |
8. | Отзыв официального оппонента | otzyiv_Budkov_ISTINA.pdf | 4,3 МБ | 7 октября 2019 | |
9. | Отзыв официального оппонента | Otzyiv_Kudryavtseva_-ISTINA.pdf | 3,3 МБ | 7 октября 2019 | |
10. | Автореферат | Avtoreferat_final.pdf | 1,2 МБ | 26 августа 2019 | |
11. | Отзыв научного руководителя/консультанта | Otzyiv_nauch_ruk_Polovnikov_1.pdf | 31,4 КБ | 17 июля 2019 |