![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
С помощью ПЦР-детекции ключевых фрагментов функциональных генов amoA с использованием коммерческих праймеров проанализирован состав аммонийокисляющих бактерий в торфяных почвах Яхромской поймы. Филогенетический анализ транслированных нуклеотидных последовательностей выявил представителей родов Nitrosolobus и Nitrosospira в качестве доминирующих нитрификаторов в торфяных почвах. Несмотря на различия в составе растительности и некоторые колебания величины рН, все доминирующие нитрификаторы торфяных почв ненарушенных биоценозов относились к кластеру Nitrosolobus – Nitrosospira. Эти данные согласуются с результатами исследования состава нитрифицирующих сообществ луговых почв Нидерландов (Smits et al., 2010, Soil Biol. Biochem, V. 42, р. 635–641), где доминирующими организмами были именно представители рода Nitrosospira. Следует отметить, что для участков торфяных почв, занятых под сельскохозяйственное использование с повышенным содержанием аммония и реакцией среды близкой к нейтральной (известкование), доминировали нитрификаторы рода Nitrosomonas. Полученные в настоящей работе последовательности генов amoA депонированы в международной базе данных GenBank под номерами JF 496679–JF 496706.
Впервые показана возможность протекания анаэробного окисления аммония и метана в торфяных почвах. Методом флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) обнаружено значительное увеличение доли архей в составе микробного сообщества при внесении окисленных соединений азота в качестве конечного акцептора электронов в анаэробных условиях. Проведена предварительная оценка вклада аммонийокисляющих архей в образование закиси азота в торфяных почвах с использованием ингибиторного анализа и газохроматографических методов детекции газообразных окислов азота.
грант РФФИ |
# | Сроки | Название |
1 | 10 января 2014 г.-31 декабря 2014 г. | этап 2014 |
Результаты этапа: | ||
2 | 1 января 2015 г.-30 декабря 2015 г. | этап 2015 года |
Результаты этапа: 1. Проанализирован состав аммонийокисляющих бактерий в дерново-подзолистой почве с помощью ПЦР-детекции ключевых фрагментов функциональных генов amoA. 2. Методом ингибиторного анализа проведена оценка активности аммонийокисляющих бактерий и архей в образцах дерново-подзолистой почвы. 3. Определена интенсивность анаэробного окисления аммония и метана в дерново-подзолистой почве. 4. В ходе лабораторного эксперимента оценен вклад аммонийокисляющих архей в образование и эмиссию газообразных окислов азота. | ||
3 | 1 января 2016 г.-31 декабря 2016 г. | Анализ состава аммонийокисляющих бактерий в торфяных почвах - этап 2016 года |
Результаты этапа: Изучено распространение анаммокс бактерий методом FISH с использованием меченого олигонуклеотидного зонда Amx820 (5'-AAAACCCCT CTA CTTAGTGCCC-3') (Schmid et al., 2000). Для выявления неспецифической авто- флюоресценции был использован меченый олигонуклеотидный зонд Non338 (5'-ACTCCTACGGGAG-GCAGC-3') (Wallner et al., 1993). Выделение ДНК из почв осуществляли с помощью Power Soil DNA Isolation Kit (MoBio Laboratories, Carlsbad, CA, USA) в соответствии с прилагаемой инструкцией. Количественный анализ копий анаммокс генов (hzsA) осуществляли Real-time PCR Detection System (Roche480, Roche, Indianapolis, IN, USA) с использованием праймеров hzsA 1594F и hzsA 1857R (Kartal et al., 2011; Harhangi et al., 2012). Как показали наши исследования, численность анаммокс бактерий, достигала 1-7 млн копий гена/ г в торфяной и дерново-подзолистой почвах, что указывает на присутствие анаммокс бактерий в исследованных почвах с явным преобладанием в гидроморфных почвах. Сопоставление нуклеотидной последовательности 16S rRNA анаммокс бактерий с базой данных GENBANK показало их принадлежность к Planctomycetaceae. |
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".