ИСТИНА

Установление закономерностей формирования генетического разнообразия природных генофондов лососевых рыб и проблема их сохранения в условиях антропогенного воздействия.

Kamchatka mykiss or Rainbow trout (Oncorhynchus (Parasalmo) mykiss) is one of the species of salmonids (Salmonidae). Mykiss combines high morphological plasticity and wide geographic distribution with importance in a world fisheries and aquaculture. Also this is a model species for the study of migrations, ecology, microevolution, phylogeny and genetic diversity of salmonids. Migrating form of Kamchatka mikizha (Kamchatka steelhead) listed in the Red book of Russia. Despite the wide distribution of this species, its natural gene pool intact mainly in the Asian part of the species area (Kamchatka Peninsula), where most populations are the least affected by anthropogenic influence. Compared with North American, Kamchtkian populations of mykiss are still poorly understood. Genetic assessment of population relationships of the species in Asian part of the area has long been hampered. Primarily, that is due to the inaccessibility of habitats, as well as with a small number of effective population-genetic markers for mykiss in the region. Previous studies have revealed a relatively low genetic diversity in Asian populations of the species. The increasing number of studied variability of genes and sites of DNA from other salmonids, as well as the authors of the new collections of material to make the actual revision of population-genetic relationships of mykiss in Asia and other parts of its natural area. This project aims at the implementation of this goal.

Из имеющихся коллекций, будет выделена и подготовлена к дальнейшей работе ДНК не менее чем от 250 особей микижи из различных мест обитания. Для отобранных образцов будет проведен анализ последовательностей генов и участков мтДНК, общим размером не менее 2500 нуклеотидов. За счет привлеченных средств, будет организован сбор дополнительного материала от проходных и жилых экоформ микижи с западного побережья Камчатки (реки Утхолок, Квачина). Планируется собрать не менее 100 новых образцов генетического материала. Будет подготовлено к публикации в рецензируемых журналах ВАК не менее 2 статей по теме проекта.

Научный коллектив авторов более 25 лет изучает различные аспекты генетического разнообразия вида Oncorhynchus (Parasalmo) mykiss, преимущественно на азиатской части ареала. Основные научные заделы, кратко: 1. Собрана большая коллекция генетического материала по камчатским представителям вида, на сегодняшний день, являющаяся самой крупной в России. 2. Отработаны различные практические подходы к исследованию генома микижи, включающие основной ряд применяемых на современном уровне молекулярно-генетических, биохимических и других лабораторных методик. 3. Создана необходимая лабораторная база для выполнения работ по проекту. 4. Исследована аллозимная изменчивость камчатской микижи по 18 белковым системам, кодируемых 40 генными локусами; проведен анализ генетической изменчивости ядерной ДНК по генам гормона роста (ITTS I, II), гену RAG3, ряду микросателлитных локусов. С помощью рестриктазного анализа ДНК и фрагментарного секвенирования проанализировано около 30% мт-генома у различных популяций Oncorhynchus (Parasalmo) mykiss. Оценена относительная вариабельность таких генов как Сytb, ND\3, ND\4, ATP6, ATP8, участка D-loop и других сайтов. Проведен SCAR, ISSR и микросателлитный анализы. Результаты этих работ находятся в открытой печати. 5. Исследовано генетическое разнообразие более чем 30 популяций камчатской микижи, оценены уровни их дивергенции и вариабельности, доказана обедненность митохондриального генома для камчатской группы. Проведены многие другие исследования, сформировавшие тему предлагаемого проекта и необходимость ее выполнения. Многие предшествующие работы были поддержаны РФФИ и доложены в принятых отчетах (проекты 96-04-48041-а; 99-04-48618-а; 02-04-48656-а; 05-04-48413-а и др.).

1. Будет выделена и исследована различными методами молекулярно-генетического анализа ДНК от не менее чем 500 особей микижи из различных водоемов Камчатки, Шантарских островов, морских уловов в Охотском море. 2. У камчатской микижи из разных выборок будет определена последовательность не исследованных ранее и до этого не используемых для популяционно-генетического анализа микижи митохондриальныx и ядерных генов. Для оценки вариабельности будет исследовано до 60% последовательности митохондриального генома. 3. Будут подобраны новые популяционно-значимые локусы мстДНК, проведен анализ микижи по совокупности известных мст-локусов, включая не используемые ранее (не менее 20). 4. Будут подобраны праймеры для SNP-маркеров и проведен анализ однонуклеотидных замен не менее чем у 10 популяций микижи. 5. По новым и накопленным данным о вариабельности генома микижи будет проведена ревизия отношений азиатских и других популяций вида на основе анализа выборок не менее чем из 40 различных мест обитания. 6. По результатам работы будут подготовлены не менее 5 публикаций в рецензируемых научных журналах, написана 1 монография.