Молекулярный дизайн, структурно-функциональный анализ и регуляция ферментных систем, клеточных конструкций, бионаноматериалов: фундаментальные основы и приложения в технологии, медицине, охране окружающей средыНИР

Molecular design, structure-function analysis and regulation of enzyme systems, cellular structures, bionanomaterials: fundamental basis and applications in technology, medicine, environmental protection

Источник финансирования НИР

госбюджет, раздел 0110 (для тем по госзаданию)

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 января 2016 г.-31 декабря 2016 г. Молекулярный дизайн, структурно-функциональный анализ и регуляция ферментных систем, клеточных конструкций, бионаноматериалов: фундаментальные основы и приложения в технологии, медицине, охране окружающей среды
Результаты этапа: В качестве альтернативы лечения антибиотиками рассматривается терапия бактериофагами и их цитолитическими ферментами, лизинами. Разрабатываются подходы к созданию высокоактивных ферментных комплексов целлюлаз и гемицеллюлаз, а также ферментов негидролитической природы, усиливающих гидролитическое действие карбогидраз для превращения в сахара возобновляемого растительного сырья. Решается актуальная задача развития новых щадящих и мало затратных методов биоремедиации, которые не будут наносить экологического ущерба болотам, загрязненным нефтью. Проводится изучение физико-химических свойств бактериальных ферментов бета-лактамаз и разрабатываются молекулярно-генетические методы их идентификации . Разработаны оригинальные биокатализаторы на основе фермента органофосфатгидролазы, проявляющие гидролитические характеристики в реакциях гидролиза токсинов различной природы (фосфорорганических пестицидов и микотоксинов), а также лактонсодержащих соединений, в частности, N-ацилгомосерин лактонов, индуцирующих развитие кворумного ответа у грамотрицательных патогенных бактерий. Проводятся фундаментальные исследования в области создания высокоэффективных (био)сенсоров на основе наноразмерных пленок электро- и биокатализаторов. Решается актуальная задача по созданию мукоадгезивных лекарственных форм. Изучены тромболитические и побочные эффекты комбинированного действия тканевого активатора плазминогена и стафилокиназы in vitro. Синтезированы конъюгаты про-урокиназы для повышения эффективности тромболизиса, разработаны новые препараты: Афкостат – для терапии кровотечений, пептиды для диагностики онкологических заболеваний. Разрабатываются реагенты, которые позволили бы проводить иммуноанализ на токсиканты в пищевых продуктах и окружающей среде. Разработки ученых кафедры предлагают использовать кальций-карботантные микросферы в качестве систем доставки лекарственного начала. Их основные достоинства - легкость получения, дешевизна, мягкие условия разложения, большая удельная площадь поверхности. Проводится изучение взаимосвязи структуры и функции люциферазы светляков в целях создания новых биоаналитических систем на основе люциферазы светляков для медицины и экологии. Проводятся работы по определению нуклеиновых кислот, которые являются хорошими маркерами для диагностики различных заболеваний, а также позволяют дифференцировать здоровую от непригодной к употреблению пищу. Разрабатываются высокочувствительные электрохимические и оптические биосенсорные системы для целей экологии, медицины и мониторинга биологической безопасности. Разрабатываются способы лечения воспалительных заболеваний глаз - одной из важнейших проблем офтальмологии во всем мире. Особое место по тяжести исходов и трудности лечения такого рода заболеваний занимают увеиты – воспалительные процессы в сосудистой оболочке глаза. Разрабатываются новые высокочувствительные экспресс-методы анализа прогестерона на основе принципов латерального проточного иммуноанализа и иммунофильтрационного анализа с использованием в качестве метки пероксидазы хрена. Проводится изучение кинетических параметров для процессов ферментативного лизиса бактериальных клеток, кинетики и термодинамики сорбции бактериолитических ферментов на бактериальных клетках. В настоящее время бактериолитические ферменты рассматриваются как одна из альтернатив антибиотикам при разработке новых лекарственных средств.
2 1 января 2017 г.-31 декабря 2017 г. Молекулярный дизайн, структурно-функциональный анализ и регуляция ферментных систем, клеточных конструкций, бионаноматериалов: фундаментальные основы и приложения в технологии, медицине, охране окружающей среды
Результаты этапа: Исследовано включение муцина в кристаллы ватерита. Проведено сравнение процессов адсорбции и соосаждения муцина в ватерит и их влияние на свойства кристаллов. Получены кривые инактивации лизинов K, phi11, phi80α, 8161, 2638a в условиях хранения, спектры кругового дихроизма K, phi11, phi80α, 8161, 2638a в условиях хранения, методики получения комплексов фермент-полимер для лизинов фагов К и phi11, химерного фермента K-L. Проведена электрополимеризация ферментов на рабочем электроде планарных трехэлектродных сенсорных структур. Исследованы аналитические свойства полученных биосенсоров в проточно-инжекционном режиме. Зарегистрированы полные градуировочные графики для вычисления таких аналитических параметров, как чувствительность, диапазон определяемых концентраций, предел обнаружения. Кроме того, исследована стабильность биосенсоров. Полученные аналитические параметры сравнивались с известными из литературы для глюкозных и лактатных биосенсоров, а также с аналитическими характеристиками биосенсоров, созданных без привлечения электрохимических стадий. Выявлена диагностическая ценность неинвазивно собираемого КВВ и установлена корреляция между содержанием метаболитов в крови и экскреторных жидкостях. Биосенсоры на глюкозу Были интегрированы в проточно-инжекционные системы с ячейками типа wall-jet для раздельного определения концентраций метаболитов. Правильность результатов анализа крови была подтверждена с использованием независимого метода на основе коммерческого анализатора. Данные по содержанию глюкозы в крови и конденсате выдыхаемого воздуха сравнивались для поиска корреляции между ними. Для повышения концентрации глюкозы в крови был использован так называемый глюкозотолерантный тест. Проведено исследование новых сенсорных материалов на основе боронат-замещенного полианилина, обладающих высокой селективностью к сахарам и оксикислотам. Сахара и оксикислоты играют важнейшую роль в метаболических процессах, поэтому разработка тест-систем на основе высокоэффективных электрохимических сенсоров для детектирования соединений этих классов представляет интерес для современной медицинской диагностики. Разработаны условия электрохимического синтеза проводящих полимеров из 2-аминофенилборной и 3-аминофенилборной кислот на поверхности стеклоуглеродных электродов методом циклической вольтамперометрии и изучены методом спектроскопии электрохимического импеданса. Разработаны СКФ-методыв микронизации субстанций ряда клинически наиболее важных производных из группы фторхинолонов, обладающих различными физико-химическими свойствами. Охарактеризованы свойства полученных субстанций (кристаллическая структура, размер и распределение частиц по размеру, растворимость, полиморные формы) в зависимости от условий проведения процесса СКФ-микронизации. Изучена растворимость полимеров и субстанций фторхинолонов в модельных системах с различными растворителями с использованием широкого спектра физико-химических методов. Разработаны СКФ-методики формирования полимерных наночастиц и инкапсулирования фторхинолононов с использованием серий биодеградируемых полимеров на основе полимолочной (PLA) и полигликолевой кислот (PGA) и их сополимеров (PLGA). Исследованы основные фармакокинетические параметры полученных лекарственных композиций (биодоступность, биодеградируемость, кинетика высвобождения препарата) в сравнении со свободными лекарственными субстанциями. Выявлены факторы (аминокислотные остатки), отвечающие за термостабильность в ксиланазе 10-го семейства гликозидгидролаз из гриба рода Penicillium. Исследована возможность использования золотых наночастиц в виде нанозвезд и нанопопкорна в латеральном проточном иммуноанализе. Проведено определение антител против возбудителей инфекционных заболеваний с использованием сухих стрипованных образцов биологических жидкостей (сыворотка, кровь). Разработаны методические подходы к проведению иммуноферменого анализа с использованием сухих образцов цельного молока, нанесенных на тонкие полоски мембранного материала. Проведен анализ кинетических характеристик высокоочищенных препаратов ангиотензин-превращающего фермента (АПФ) из сердца и легких человека. Проведена оценка вероятных конформационных различий поверхности АПФ из легких и сердца с использованием панели из 17 моноклональных антител (мАт), направленных к различным эпитопам на двух доменах АПФ. Сделан вывод о возможности или невозможности получения в дальнейшем мАт, способных специфично распознавать в кори АПФ из сердца на фоне высокого содержания АПФ из легких. Исследовано влияние различных доз концентрации акцептора электронов на анаэробный процесс деградации углеводородных загрязнений аэробными бактериями рода Rhodococcus. Получены новые мутанты люциферазы Luciola mingrelica и кодон-оптимизированной люциферазы Photinus pyralis с повышенной активностью, различными максимумами в спектрах биолюминесценции и различной термостабильностью, пригодные для использования в качестве репортерных белков при исследовании механизмов внутриклеточных процессов в клетках млекопитающих Изучено влияние мутаций в люциферазе светляков L. mingrelica поверхностных аминокислотных остатков, предположительно влияющих на стабильность различных конформеров фермента: аденилирующего и окисляющего конформеров фермента. Наработаны мутанты и охарактеризованы их каталитические свойств, термостабильность и спектры биолюминесценции при различных рН и температурах. Продолжена работа по разработке, использованию и внедрению биолюминесцентного экспресс-метода определения специфической активности туберкулезной вакцины на основе живых клеток микобактерий по содержанию внутриклеточного АТФ. Оптимизирован латеральный проточный анализ ДНК с использованием меченых зондов. Проведены молекулярный дизайн и синтез флуоресцеин-меченных трейсеров для разработки поляризационного флуороиммуноанализа пестицидов карбарила и триазофоса для целей охраны окружающей среды Разработаны инновационные биотехнологические процессы, использующие моно- и мультиферментные биокатализаторы и предназначенные для применения в технологии биосинтеза коммерчески-значимых продуктов, медицине, защите окружающей среды. Проведен синтез конъюгатов стрептокиназы с РАМАМ дендримерами различной генерации и изучены их кинетические свойства. Разработан метод получения фрагментов IgG специфическим его расщеплением плазмином. Выяснен механизм синергичного тромболизиса под действием комбинаций различных активаторов плазминогена. Исследована реакция цепной гибридизации олигонуклеотидных шпилек, химически модифицированных гемином. В рамках биомиметических исследований изучен эффект энантиоселективности в реакциях гидролиза оптически активных сложных эфиров в присутствии оптически активных циклопалладированных комплексов. Исследованы возможности терагерцевой спектроскопии для изучения конформационных изменений белка на примере химотрипсина и альбумина.
3 1 января 2018 г.-31 декабря 2018 г. Молекулярный дизайн, структурно-функциональный анализ и регуляция ферментных систем, клеточных конструкций, бионаноматериалов: фундаментальные основы и приложения в технологии, медицине, охране окружающей среды
Результаты этапа: Проведены фундаментальные исследования в области создания высокоэффективных (био)сенсоров на основе наноразмерных пленок электро- и биокатализаторов. Неинвазивная диагностика является наиболее перспективной областью клинической диагностики, поскольку она не допускает ни повреждения стенок кровеносных сосудов, ни нарушения целостности кожных покровов. Концентрация метаболитов в экскреторных жидкостях обычно ниже, чем в крови. Поэтому с целью повышения чувствительности используется созданный нами более 20 лет назад электрокатализатор восстановления пероксида водорода на основе берлинской лазури (БЛ). Была проведена разработка проточно-инжекционной электроаналитической системы для совместного определения глюкозы и лактата, исследование взаимовлияния глюкозы и лактата при их совместном определении с помощью мультибиосенсора. Для повышения экспрессности анализа крови сконструирована тонкослойная ячейка для совместного действия лактатного и глюкозного биосенсоров Было достигнуто увеличение селективности сенсорного материала на основе сополимера фенилбороновой кислоты и анилина для определения лактата методом темплатного синтеза. Осуществлен электрохимический синтез проводящего полимера 3-АФБК с молекулярными отпечатками лактата на поверхности планарных электродов. Доказано, что синтезированный сенсорный материал обладает свойствами проводящего полианилина и может быть использован для создания неферментативного анализа лактата в поте. В 2018 г. были проведены работы по внедрению на предприятии фирмы Микроген разработанного в нашей лаборатории биолюминесцентного АТФ-метода определения жизнеспособности клеток микобактерий. Целью работ является повышение качества выпускаемой продукции и совершенствование процесса производства лекарственного препарата: «БЦЖ вакцина противотуберкулезная». Установлена корреляция между содержанием внутриклеточного АТФ и КОЕ в жидкой БЦЖ вакцине. Были проведены разработки по использованию биолюминесцентных методов для изучения влияния клеточного стресса на жизнеспособность живых клеток. На примере рекомбинантных клеток E.coli, продуцирующих люциферазу светляков, показана корреляция между активностью люциферазы и жизнеспособностью клеток при воздействии теплового стресса. Начаты работы по созданию люциферазных репортеров для изучения кинетики и механизма функционирования клеток млекопитающих. Проведено изучение кинетики ферментативного лизиса на субстратах - живых бактериальных клетках. Установлено влияние эффекторов - различных аминокислот: Характер влияния эффектора на каталитическую активность различный, в зависимости от функциональных групп эффектора и от субстрата. Проведено формально-кинетическое описание ферментативного лизиса бактериальных клеток. Разработан метод расчета скорости лизиса клеточных субстратов бактериолитическими ферментами по турбидиметрическим данным. Предпринят поиск активаторов бактериолитических ферментов. Изучен процесс разрушения биомассы мицелиальных грибов рода Penicillium и Aspergillus, продуцентов промышленных ферментов, под действием ферментных препаратов, обладающих высокой активностью по отношению к основным полисахаридам грибной клеточной стенки – эндо-β-1,3-глюканазы (Lam70), эндохитиназы (Chi426), эндо-β-1,4-маннаназы (ManB) и ферментных препарата, содержащего эндо-β-1,3-глюканазу и эндохитиназу (Lam70-Chi426). Показано, что для наиболее полной деструкции клеточной стенки мицелия P.verruculosum и A.awamori требуется одновременное использование эндо-β-1,3-глюканазны, эндохитиназы и эндо-β-1,4-маннаназы. Изученоы возможности последовательного применения процессов окислительной деполимеризации и кислотного гидролиза для предобработки лигноцеллюлозной биомассы (солома, опилки и лигнин), что позволило получить более высокое содержание в гидролизате растворимых органических веществ (44–94 г ХПК/л) и увеличить концентрацию восстанавливающих сахаров с 1% до 36%. Внесение бактерий Clostridium acetobutylicum в кислотогенный биокатализатор привело к еще большему повышению содержания в конечном продукте летучих жирных кислот и этанола. Добавление глицерина в качестве субстрата позволяет увеличить выход масляной и уксусной кислот в процессе конверсии предобработанной биомассы; при добавлении к соломе глицерина в соотношении 1:1 максимальный выход масляной кислоты и летучих жирных кислот составил 32% (0,96 г/л) и 72% (2,67 г/л), соответственно. Проанализированы закономерности каталитической ароматизации пропилена. Исследована возможность ферментативного окисления графена. Проведена оптимизация определения белковых антигенов с использованием специфических антител и двух типов меток (ферментативной и наночастиц золота). Разработана методика определения ферментативной активности бета-лактамаз в периплазматических фракциях клеток-продуцентов с использованием различных субстратных систем. Установлено, что катионные РАМАМ дендримеры низких генераций мало влияют, а анионные дендримеры ингибируют активность ключевых ферментов системы гемостаза in vitro. Показано, что конъюгация стрептокиназы и проурокиназы с анионными РАМАМ дендримером G3.5 значительно повышает стабильность в плазме и тромболитическую эффективность активаторов. Продолжены исследования по повышению стабильности тромболитических агентов в плазме путем ковалентной и нековалентной их модификации различными полимерами. Были исследованы новые подходы к рациональному компьютерному отбору и прогнозированию характеристик ферментов, катализирующих деградацию опасных нейротоксичных фосфорорганических соединений, а также различных микотоксинов и молекул-индукторов кворумного ответа, полученные результаты апробированы в ходе экспериментальных исследований. Были разработаны новые мультиферментные иммобилизованные биокатализаторы, продуцирующие наноцеллюлозу и пуллулан, выявлены закономерности влияния иммобилизации на функционирование биокатализаторов. Исследованы новые возможности биокаталитической конверсии возобновляемого сырья в востребованные коммерческие продукты. Продолжены исследования возможности стимул-чувствительных полиэлектролитов для сборки полиферментных систем на поверхности сенсорных элементов. Впервые проведены исследования ГКР спектров микробных клеток и вирусных частиц, субстратов и продуктов холинэстераз на поверхности тонкопленочных оптических метаматериалов различной структуры, на поверхности наночастиц серебра. Найдены методы модификации метаматериалов на основе диэлектрических и плазмонных резонаторов, а также наноразмерных частиц золота и серебра, что позволило повысить интенсивность и селективность сигналов ГКР. Все это имеет важное практическое значение для ранней диагностики развития сердечно-сосудистых заболеваний, онкологических заболеваний, воспалительных процессов, создания систем экологического и химико-токсикологического мониторинга. Разработана многофункциональная биоаналитическая платформа на основе самоорганизующихся наноструктур, включающих био и макромолекулы Исследовано формирование и устойчивость в водной среде комплексов ферментов с противоположно и одноименно заряженными макромолекулами. Охарактеризован состав и физико-химические свойства комплексов, а также активности ферментов в составе комплексов. Разработан метод определения муцина с использованием аналитической гель-фильтрации, позволяющий определять гликопротеин в биологических жидкостях. Исследована адсорбция муцина бактериями Escherichia coli из кишечника человека с болезнью Крона и здоровых добровольцев. Проведена разработка конкрентного метода определения тромбина человека. Планетный метод основывался на применении аптамера ТВА 15. Предел определения разрабатываемого метода равен 1 нМ. С целью разработки новых подходов для лечения воспалительных заболеваний глаз исследовано влияние концентрации супероксиддисмутазы (СОД) на включение в СаСO3 микросферы. Эффективность включения уменьшалась с увеличением концентрации белка. Эффективность связывания набора из 17 моноклональных антител (мАт), направленных к различным конформационным эпитопам на поверхности двух доменов ангиотензин-превращающего фермента (АПФ) человека (конформационный «портрет»), значительно отличается для АПФ, выделенных из разных органов. Исследована кинетика высвобождения белка из микросфер в 0,15 М растворе NaCl, моделирующем различные биологические жидкости живых организмов. Исследование с помощью СЭМ внешнего вида микрокристаллов выявило полную перекристаллизацию ватерита в кальцит через 24 ч. Для лечения травмы спинного мозга на основе антиоксидантного фермента супероксиддисмутазы-1 (SOD1) созданы новые химически сшитые многослойные полиионные комплексы. Совместно с ФГБУ "Национальный медицинский исследовательский центр психиатрии и наркологии имени В.П.Сербского" выполнены фармакокинетические исследования полученных наноформуляций на животных моделях. Доказано улучшение восстановления двигательных функций у крыс с умеренной травмой спинного мозга, наряду с уменьшением отека, сопутствующей компрессии спинного мозга и образованием посттравматических кист. Нанозимы SOD1 с двойным покрытием показали значительную терапевтическую активность при лечении воспалительных заболеваний глаз. Созданные и наработанные в достаточных количествах на кафедре химической энзимологии Химического факультета МГУ образцы препаратов были переданы в ООО "МедНаноТех" для проведения доклинических испытаний, которые были успешно завершены. В рамках этого направления совместно с ООО "МедНаноТех" и Институтом глазных болезней им. Гельмгольца был разработан простой и чувствительный метод оценки протекания глазных болезней, связанных с воспалительными процессами. Метод основан на использовании платиновых наноэлектродов и позволяет определять активные формы кислорода (АФК) и уровень пероксида водорода в биологических жидкостях (слезная и внутриглазная жидкости), а также наблюдать динамику изменения уровня перекиси водорода при антиоксидантной терапии вплоть до 1 мкМ. Показано постепенное проникновение SOD1 в составе полимерных наночастиц во внутренние структуры глаза. Использование данного метода представляется эффективным для диагностики и контроля лечения глазных заболеваний. С целью создания антибактериальных препаратов нового поколения на основе ферментов бактериофагов проведено исследование литических ферментов с мукоадгезивными полимерами, выявлено образование ферментполиэлектролитных комплексов. Изучено влияние различных типов блок-сополимеров на вторичную структуру и стабильность антистафилококкового фермента Lysk. Показано, что комплексообразование между LysK и катионными блок-сополимерами приводит к увеличению литической активности LysK в 1,5–2 раза и увеличению периода полураспада фермента в 2–20 раз. Линейный PLL-PEG обеспечивает увеличение стабильности LysK, подходящей для биомедицинских материалов (фермент сохраняет 100% активности через четыре месяца хранения при 4°C). Разрабатываются системы внутриклеточной доставки противораковых препаратов с ультранизкой водорастворимостью. В качестве носителя для высоко гидрофобного противоопухолевого препарата доцетаксела из класса таксанов предложено использовать стабилизированную наноэмульсию типа масло в воде (м/в). Стабильность и цитотоксичность полученной системы исследовали in vitro на клетках рака молочной железы MCF-7. На модели солидной опухоли показано увеличение эффективности действия доцетаксела в форме наноэмульсии по сравнению с коммерческим препаратом Taxotere. Проводятся работы, направленные на создание систем доставки лекарственных средств с использованием экзосом для лечения нейродегенеративных заболеваний и рака. Совместно с учеными из Университета Севрной Каролины (США) получены новые наноформуляции на основе экзосом, нагруженных противораковым агентом паклитакселом (PTX) с включением аминоэтиланизамид-полиэтиленгликоля (AA-PEG) в качестве вектора для взаимодействия с сигма-рецептором, который сверхэкспрессируется клетками рака легких. Разработан метод создания искусственных экзосом из липидов, входящих в состав природных. Проведены исследования методом Фурье-FTIR, изучаются свойства и возможности полученных систем для создания лекарств на их основе.
4 1 января 2019 г.-31 декабря 2019 г. Молекулярный дизайн, структурно-функциональный анализ и регуляция ферментных систем, клеточных конструкций, бионаноматериалов: фундаментальные основы и приложения в технологии, медицине, охране окружающей среды
Результаты этапа: Проведён структурно-функциональный анализ моно- и мультиферментных систем для решения актуальных проблем науки, технологии, медицины, защиты окружающей среды. Проанализированы и адаптированы подходы к получению иммобилизованных биокатализаторов на основе таких систем. Исследованы возможности применения биокатализаторов в ходе решения приоритетных задач. С использованием компьютерного моделирования путём докинга субстратов к активному центру фермента впервые исследована возможность гидролиза 12 различных фосфорорганических агентов и продуктов их разложения под действием органофосфатгидролазы (OPH) и её генетически модифицированной формы (His6-OPH). Были разработаны воспроизводимые электрохимические наноэлектроды для определения концентрации АФК, уровня кислорода. С помощью разработанных наноэлектродов на отрицательных потенциалах возможно определение уровня кислорода, на положительных потенциалах возможно определение активных форм кислорода при измерениях, проводимых относительно хлорсеребряного электрода. Полученные данные показали, что среда внутри опухоли имеет более низкие значения рН по сравнению с нормальной тканью. При этом уровень кислотности выше в глубоких слоях опухоли, чем в поверхностных. Кроме того, было выявлено, что уровень кислотности в опухоли может отличаться как от опухоли к опухоли, так и внутри одной опухоли в зависимости от конкретной зоны. Таким образом, разработанный электрохимический метод определения pH в заданной точке ткани животного позволяет оценить уровень кислотности в опухоли в режиме реального времени в животном. Разрабатываемые гибридные микросферы ватерита могут быть перспективными для мукозальной доставки низкомолекулярных лекарственных веществ, включая белки, ферменты и противораковые препараты, поскольку биоразлагаемые и биосовместимые микросферы ватерита используются в качестве контейнеров для включения лекарственных веществ различной природы. Проведен анализ результатов производственных испытаний на предприятии фирмы Микроген разработанного нами биолюминесцентного АТФ-метода для оперативного контроля активности противотуберкулезной БЦЖ вакцины. Использованный метод позволил сократить время анализа с 28 суток до 1 часа. Разработаны критерии оценки качества финального лиофилизованного препарата БЦЖ вакцины по содержанию внутриклеточного АТФ в жидкой БЦЖ вакцине. Сконструированы биолюминесцентные системы на основе люциферазы светляков для изучения стрессовых воздействий физической и химической природы на клетки бактерий и млекопитающих. Разработан новый способ амплификации аналитического сигнала в гибридизационном анализе ДНК на биочипах с наночастицами золота в качестве метки. В работе исследовали модельные олигонуклеотиды длиной 18 оснований и образцы ДНК бета-лактамаз ТЕМ типа, выделенные из культур бактерий, устойчивых к бета-лактманым антибиотикам. В качестве метки ДНК использовали биотин, который затем выявляли в дуплексах ДНК на поверхности биочипов с использованием конъюгатов стрептавидина с наночастицами золота. Разработанная методика применена для определения генов бета-лактамаз ТЕМ типа, обуславливающих устойчивость бактерий к бета-лактамным антибиотикам. Применение реакции амплификации позволило снизить предел обнаружения в 20 раз, он составил 9.0 пг/мл. Оптимизирована методика выделения бактериолитически активных фракций серотрансферина из плазмы крови человека. Подтверждена чистота препарата. Подобраны оптимальные соотношения компонентов для получения прототипа высокоэффективного антибактериального лекарственного средства для применения в качестве альтернативы антибиотикам в случае антибиотикрезистентности микроорганизмов. Проведено исследование эффектов РАМАМ дендримеров низких генераций (на ключевые компоненты системы гемостаза. Впервые обнаружено, что анионные РАМАМ дендримеры изменяют структуру нативного плазминогена, что приводит к ингибированию скорости его активации эндогенными активаторами. РАМАМ дендримеры различной генерации являются перспективными носителями лекарств, биомакромолекул и в МРТ-диагностике в качестве контрастирующего агента. Разработаны микрокапсулы с регулированной скоростью высвобождения стрептокиназы (активатора плазминогена непрямого действия). Применение этой формы стрептокиназы может повысить эффективность тромболитической терапии благодаря пролонгированию действия и снижению побочных эффектов. Впервые обнаружено увеличение концентрации продуктов деградации IgG в крови пациентов с раком простаты. Результаты могут быть использованы для разработки диагностикума для выявления рака предстательной железы на ранней стадии. Полученны двухслойные полимер-ферментные пленки и охарактеризованы методом пьезоэлектрического микровзвешивания, электрокинетического анализа, атомно силовой микроскопии. Аналитические характеристики полученных ферментных биосенсоров были изучены методами электрохимии. Подобраны оптимальные мультиферментные смеси, включающие эти ферменты, а также дополнительно эндо- или экзо-арабиназы, эндо-галактаназу, β-ксилозидазу, эндо-ксиланазу и/или α-арабинофуранозидазу, которые обеспечивали степень гидролиза СЖ (по выходу восстанавливающих сахаров) 61-68%, по выходу арабинозы – 94%, глюкозы 63-79%. Мультиферментная композиция, состоящая из сухих ферментных препаратов целлюлаз, гемицеллюлаз и пектиназ, полученных на основе штаммов грибов Penicillium canescens, P.verruculosum и Aspergillus foetidus, обеспечивала степень гидролиза СЖ по арабинозе и глюкозе близкой к 100% Оптимизирован процесс получения максимального количества летучих жирных кислот (ЛЖК) и этанола на наиболее перспективных образцах биомассы (пшеничная солома и мискантус) модифицированным биокатализатором при подобранной высокой концентрации субстратов и температуры проведения процесса биоконверсии с последующей этерифицикацией их в суперкритическом этаноле. Эти результаты можно напрямую использовать при организации полупромышленного производства ЛЖК и этанола для нужд промышленности из отходов агропромышленного комплекса (АПК) и другого возобновляемого сырья. Проведена характеристика ангиотензин-превращающего фермента (АПФ) в тканях предстательной железы у пациентов с доброкачественной гиперплазией предстательной железы и раком предстательной железы с использованием комплексного подхода - фенотипирования АПФ. Разработан высокочувствительный метод определения содержания активной формы ингибитора АПФ – эналаприлата по остаточной активности фермента с пределом обнаружения 0,1 нМ. Разработан новый непрямой метод определения активности карбоксилэстеразы с использованием фармакологически важного субстрата – эналаприла (проформа ингибитора АПФ). Проведён анализ литературных данных по современному состоянию в области иммобилизации ферментов и клеток микроорганизмов в полимерные носители, получаемые при криогенной обработке. Выявлены ключевые факторы, влияющие на эффективность получения таких биокатализаторов и их дальнейшего функционирования в различных биотехнологических процессах (в том числе, биомедицине, нанотехнологиях, биосенсорах, охране окружающей среды и т.д.). Определены основные направления для дальнейшего развития в данной области, и сформулированы стратегии для улучшения уже существующих (мульти)ферментных и клеточных систем.
5 1 января 2020 г.-31 декабря 2020 г. Молекулярный дизайн, структурно-функциональный анализ и регуляция ферментных систем, клеточных конструкций, бионаноматериалов: фундаментальные основы и приложения в технологии, медицине, охране окружающей среды
Результаты этапа: В результате проведения исследований были получены следующие результаты: Разработан протокол применения термогелиокса при лечении коронаврусной инфекции. Открыто новое медико-биологическо явление — термовакцинация, основанное на стимулировании синтеза специфических антител при использовании термогелиокса. Разработка композиций на основе лизоцима и смеси аминокислот с повышенной эффективностью антибактериального действия важно для создания новых перспективных антибактериальных препаратов для борьбы с антибиотико резистентными микроорганизмами. С практической точки зрения важность в том, что в перспективе возможно создание композиций на основе лизоцима для усиления иммунного ответа не только при бактериальном заражении, но и при других заболеваниях, в том числе вероятно при вирусных поражениях и возможно при онкологических процессах. При оценке возможностей метода КР спектроскопии для изучения кинетики химических и ферментативных превращений показано, что метод работает, а, следовательно, может быть достаточно широко применен для исследования ферментативных и неферментативных превращений. Проведен комплекс исследований по кинетике химических реакций в мозге человека. Результаты проведенных трех серий экспериментов in vivo по сравнению влияния эналаприлата в составе частиц и в форме водного раствора на внутриглазное давление (ВГД) у кроликов породы шиншилла продемонстрировали, что включение эналаприлата в CaPh-частицы, покрытые хитозанами, позволило добиться значительного усиления гипотензивного действия препарата, а также пролонгации их действия. На основании спектральных пиков идентифицированы аминокислотные остатки белка, взаимодействующие с матрицей. Предложена модель посадки АПФ на серебряный носитель. Для диагностических целей разработан градиентный иммунохроматографический анализ, позволяющий проводить быстрое полуколичественное определение прокальцитонина в диагностически значимых четырех диапазонах концентраций. Предложены подходы для дальнейшего усовершенствования методики, которая может быть в дальнейшем использована в клинических микробиологических лабораториях для идентификации генетических детерминант устойчивости патогенных бактерий к бета-лактамным антибиотикам. Одним из механизмов распространения устойчивых к антибиотикам бактерий в окружающей среде является загрязнение объектов среды остаточными количествами антибиотиков вследствие их активного применения в ветеринарии и клинической медицине. Поэтому актуальным является постоянный контроль воды и продуктов питания на содержание антибиотиков. При разработке высокочувствительной иммунохроматографической тест-системы для количественного экспресс-определения хлорамфеникола (ХАФ) в молоке - ХАФ (другое название левомицетин) представляет собой антибиотик широкого спектра действия, характеризующийся хорошими антибактериальными и фармакокинетическими свойствами – разработан метд, который характеризуется хорошей чувствительностью, является экспрессным и может быть использован для определения остаточных количеств ХАФ в продуктах питания. На основе нового подхода, основанного на применении композитных ферментсодержащих мембран, разработаны лактатные биосенсоры с диапазоном определяемых концентраций, соответствующих содержанию лактата в поте, совместимые с прототипом устройства для анализа пота. Такие устройства должны найти широкое применение в клинической и спортивной медицине. Показано повышение эффективности биоэлектрокатализа глюкозодегидрогеназы за счет ориентации на модифированных поверхностях электродов. Создан подход одностадийного изготовления глюкозных биосенсоров с применением перфторсульфонированного полимера и углеродных наноматериалов. На основании анализа литературных и собственных данных авторов сделан вывод, что эмиттер в люциферин-люциферазных системах является внутримолекулярной меткой, характеризующей физико-химические свойства его микроокружения в активном центре фермента. При разработке высокочувствительных методов анализа нуклеиновых кислот с применением амплифицирующего метода с использованием шпилечных зондов был разработан анализ микРНК как метод ранней диагностики онкологических заболеваний, однако стратегия разработки данного метода может послужить фундаментальной основой для создания методов диагностики других заболеваний. Проведенные исследования позволяют понять механизм взаимодействия (включения, высвобождения) белков с микрокристаллами ватерита, причины потери активности ферментов, и тем самым помочь в создании средств доставки ферментов с высоким сохранением активности на основе микрокристаллов ватерита с различной пористостью. Впервые исследован механизм включения с помощью адсорбции и соосаждения белков и ферментов в микрокристаллы ватерита с различной пористостью. Изучено влияние условий проведения процесса и агрегации белков на загрузку, сохранение биологической активности и удерживания в частицах антиоксидантного фермента каталазы. Полученные результаты открывают новые перспективы создания средств доставки биологически активных веществ на основе микрокристаллов ватерита с различной архитектурой. Для исследования эффективной биоконверсии целлюлозосодержащих материалов под действием ферментов целлюлазного комплекса необходимо присутствие в реакционной смеси так называемых вспомогательных ферментов, функционирующих в синергизме с целлюлазами. Полученные результаты могут быть применены при реализации биотехнологических процессов биоконверсии возобновляемого непищевого растительного сырья в различные полезные продукты. Комплекс проведенных физико-химических исследований позволил установить структуру, состав, морфологию и магнитные свойства железосодержащих наночастиц, образующихся в инкапсулинах, экспрессирующихся в клетках HEK293T в результате транзиентной трансфекции. Полученные данные свидетельствуют о большом потенциале Qt инкапсулинов в качестве меток для мониторинга клеток. Были изготовлены воспроизводимые электрохимические наноэлектроды для определения концентрации АФК, уровня кислорода. С помощью разработанных наноэлектродов на отрицательных потенциалах возможно определение уровня кислорода, на положительных потенциалах возможно определение активных форм кислорода при измерениях, проводимых относительно хлорсеребряного электрода. Было показано проникновение рибофлавина внутрь сфероидов B16, который может выступать в качестве агента для фотодинамической терапии меланомы. Была измерена общая концентрация АФК, которые вырабатывались под локальным действием света на фотосенсибилизатор, на разных глубинах сфероида. Исследована аффинность и получены термодинамические константы диссоциации (KD) для ряда лигандов три- и тетратерпеновой природы, хинолиновой природы, а также референсных лигандов (галактозы и N-ацетилгалактозамина). Полученные данные использовались для анализа взаимосвязи «структура-функция» для дальнейшего конструирования высокоаффинных соединений-лигандов для направленной на гепатоциты доставки лекарств.

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".

Прикрепленные файлы


Имя Описание Имя файла Размер Добавлен
2. KaryakinaAktbiot.pdf KaryakinaAktbiot.pdf 250,1 КБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
3. Reshenie_o_vyidache_po_zayavke_No2017114420.pdf Reshenie_o_vyidache_po_zayavke_No2017114420.pdf 5,5 МБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
4. Uvedomlenie_o_postuplenii_zayavki_No2018104872.pdf Uvedomlenie_o_postuplenii_zayavki_No2018104872.pdf 912,2 КБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
5. VohmyaninaBNP2018-2.pdf VohmyaninaBNP2018-2.pdf 496,7 КБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
6. Karpova_BNP2018.pdf Karpova_BNP2018.pdf 505,5 КБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
7. KaryakinAA_BNP2018_125.pdf KaryakinAA_BNP2018_125.pdf 239,9 КБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
8. Vohmyanina_2.pdf Vohmyanina_2.pdf 620,8 КБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
9. Pages_from_Elan_3APBA_Penicillium_181.pdf Pages_from_Elan_3APBA_Penicillium_181.pdf 202,0 КБ 19 декабря 2018 [KaryakinaEE]
10. Полный текст с обложкой и выходными данными сборника Gusakov_abstract_BC-2019.pdf 958,3 КБ 29 ноября 2019 [avgusakov]