| 1 |
1 января 2011 г.-31 декабря 2011 г. |
Особенности генофодов лососевых рыб (Salmonidae) со сложной популяционной структурой |
| Результаты этапа: Исследовано генетическое разнообразие камчатских гольцов (род Salvelinus) и микижи (Parasalmo (O.) mykiss) по аллозимным маркерам, микросателлитным локусам ядерной и участкам митохондриальной ДНК. Показано, что если разнонерестующие группировки проходной микижи из речной системы реки Коль (западное побережье Камчатки) не различаются по частотам полиморфных маркеров (аллозимные локусы), то у гольцов озерные популяции (озеро Кроноцкое) генетически различаются между собой и исходной проходной популяции мальмы (митохондриальные локусы). Это является важным шагом для дальнейших исследований в рамках проекта. Всего исследовано около 500 рыб от разных модельных видов и камчатских популяций лососевых рыб. Собран основной коллекционный материал для последующих лабораторных исследований и камеральной обработки. По первому году работы сдано в печать 10 из них опубликовано 7 научных публикации по теме проекта. |
| 2 |
1 января 2012 г.-31 декабря 2012 г. |
Особенности генофодов лососевых рыб (Salmonidae) со сложной популяционной структурой |
| Результаты этапа: Впервые найдена географическая дифференциация между западно- и восточнобережными популяциями камчатской микижи по SCAR- ISSR- и микросателлитным маркерам, все три системы маркеров подтверждают результаты друг друга. Особо сильная генетическая дифференциация найдена на выборках микижи с восточнобережной камчатской реки Жупанова по двум системам маркеров (SCAR- и ISSR-маркерам). Этот факт очень интересен и нуждается в дальнейших исследованиях на больших выборках рыб.
Анализ микросателлитных локусов гольцов рода (Salvelinus) показал, что выборка носатого гольца имеет достоверные генетические отличия по семи использованным локусам от выборок длинноголового гольца и белого гольца. Выборки длинноголового и белого гольцов имеют неоднородную структуру, в которой разные особи демонстрируют принадлежность к разным группировкам.
Собран дополнительный материал для более полного генетического анализа рыб семейства лососевые (Salmonidae). За второй год проекта опубликовано 5 работ. |
| 3 |
1 января 2013 г.-31 декабря 2013 г. |
Особенности генофодов лососевых рыб (Salmonidae) со сложной популяционной структурой |
| Результаты этапа: Расширенный анализ популяций микижи при помощи, созданных в нашей лаборатории SCAR и ISSR-маркеров, а так же микросателлитных локусов, показал высокую разрешающую способность этих методов для рыб данного вида. Получены не только географические отличия между популяциями востока, запада Камчатки, северной Америкой и Чили, но и практически по каждой отдельно взятой популяции. Не смотря на близость восточно- и западнокамчатских популяций микижи, что говорит об обширном обмене генов между этими регионами, найдены значительные отличия популяции из восточнокамчатской реки Жупанова, что требует дальнейшего изучения.
Изучение изменчивости двух участков митохондриального генома (контрольного региона (D-loop) мтДНК длиной 558 п.н. и последовательность гена Cytb длиной 1015 п.н.) общей длиной 1573 п.н. для 336 образцов камчатских гольцов показало, что проходная мальма из реки Кроноцкой является предковой по отношению к озерным формам, так как имеет все массовые гаплотипы озерных гольцов. Гольцы из других водоемов Камчатки, взятые в качестве реперов, имеют гаплотипы которые обнаружены у гольцов озерно-речной системы Кроноцкое, а так же гаплотипы которые у гольцов озерно-речной системы Кроноцкое не выявлены. При этом все гаплотипы реперных выборок гольцов отличаются максимально на три мутации от гольцов озерно-речной системы Кроноцкая, что говорит об общем происхождении всех Камчатских гольцов.
Анализ 74 образцов нерки по контрольному региону мтДНК (814 пн) из разных водоемов Камчатки не выявил определенных различий между жилой и проходной формами нерки, регионального распределения между западом и востоком Камчатки, но позволил найти дифференциацию между формами нерки с разными типами питания. Планктофаги и бентофаги озера Кроноцкого попадают преимущественно в разные кластеры филогенетического дерева.
За весь период проекта опубликовано 18 работ.
|
