Молекулярные механизмы действия эндогенных нейропептидов семейства Ly6/uPAR, модулирующих работу никотинового ацетилхолинового рецептораНИР

Molecular mechanisms of action of endogenous neuropeptides family Ly6 / uPAR, modulating operation of nicotinic acetylcholine receptor

Источник финансирования НИР

грант РНФ

Этапы НИР

# Сроки Название
1 24 июня 2014 г.-31 декабря 2014 г. Молекулярные механизмы действия эндогенных нейропептидов семейства Ly6/uPAR, модулирующих работу никотинового ацетилхолинового рецептора
Результаты этапа: Белки человека SLURP-1 и SLURP-2, принадлежащие семейству Ly-6/uPAR, секретируются в различных клетках организма, включая эпителий и иммунную систему. Эти белки выступают в качестве ауто/паракринных гормонов, регулирующих рост и дифференцировку кератиноцитов, а также задействованы в контроле развития воспалительных процессов и злокачественной трансформации клеток. Предполагаемой мишенью действия SLURP-1 и SLURP-2 являются никотиновые ацетилхолиновые рецепторы (nAChR) α7 и α3β2 типов, соответственно. Детальные молекулярные механизмы, лежащие в основе действия SLURP-1 и SLURP-2, в настоящее время остаются не охарактеризованными. SLURP-2 является одним из наименее изученных белков семейства Ly-6/uPAR. В представленной работе впервые разработана система бактериальной продукции SLURP-2 и протокол ренатурации белка из цитоплазматических телец включения. Получены миллиграммовые количества рекомбинантного SLURP-2 и его 13С-15N-меченого аналога. Рекомбинантный белок охарактеризован методом ЯМР-спектроскопии, и построена модель пространственной структуры SLURP-2. На клетках колоректальной аденокарциномы человека НТ-29, экспрессирующих nAChR только α7 типа, проведено сравнительное исследование действия рекомбинантных белков SLURP-1 и SLURP-2. Показано, что SLURP-1 и SLURP-2 оказывают антипролиферативный эффект, вызывая значительное снижение популяции клеток в течение 48 часов. Флуоресцентная микроскопия не выявила ни апоптотической, ни некротической гибели клеток. Полуэффективные концентрации (ЕС50) составили ~ 0.1 и 0.2 нМ для SLURP-1 и SLURP-2, соответственно. Максимальный эффект (~ 54 и 63 % живых клеток относительно контроля) наблюдался при концентрации SLURP-1 и SLURP-2 1 мкМ. Полученные данные указывают на nAChR α7 типа как на главный рецептор, ответственный за антипролиферативный эффект белков SLURP в эпителиальных клетках человека.
2 1 января 2015 г.-31 декабря 2015 г. Молекулярные механизмы действия эндогенных нейропептидов семейства Ly6/uPAR, модулирующих работу никотинового ацетилхолинового рецептора
Результаты этапа:
3 1 января 2016 г.-31 декабря 2016 г. Молекулярные механизмы действия эндогенных нейропептидов семейства Ly6/uPAR, модулирующих работу никотинового ацетилхолинового рецептора
Результаты этапа: В ходе выполнения третьего этапа проекта были получены миллиграммовые количества мутантных вариантов SLURP-2 со следующими заменами в первой, второй и третьей петлях: F9A, R17A, R20A, D21A, R31A, E37A, D38A, D52A, Y61A. Для каждого из мутантных вариантов были оптимизированы протоколы ренатурации с целью получения наибольшего выхода конечного продукта. Анализ с помощью 1Н ЯМР-спектроскопии и масс-спектрометрии подтвердил наличие корректной пространственной структуры всех 9ти мутантов, близкой к структуре рекомбинатного SLURP-2. Методами электрофизиологии на ооцитах было исследовано влияние точечных замен в молекуле SLURP-2 на взаимодействие с а7-nAChR и а3б2-nAChR при концентрации нейропептидов 0.3 мкМ. Было показано, что введение мутаций в третью петлю (D52A, Y61A) заметно уменьшает ингибирующую активность мутантных нейропептидов на а3б2-nAChR (на ~ 50% по сравнению с SLURP-2). Небольшие изменения в активности наблюдались для мутантных вариантов с заменами во второй петле (на ~ 15-20 % по сравнению с SLURP-2), в то время как замены в первой петле никак не влияли на активность нейропептида. В случае а7-nAChR, замены в первой петле также никак не влияли на активность SLURP-2, замены во второй петле приводили к усилению активности нейропептида до 50%, а замены в третьей петле приводили к полной инактивации SLURP-2. Проведено исследование влияния мутантных вариантов нейропептидов SLURP-1 и SLURP-2 на пролиферацию и процессы апоптоза в клетках линии Het-1A. Для SLURP-1 было показано, что замены в петлях I и III приводили к уменьшению антипролиферативной активности SLURP-1, вплоть до полного исчезновения (замены остатков 59, 61, 67). Замены во второй петле наоборот усиливали антипролиферативную активность нейропептида (38,39,40,41, ингибирование пролиферации на 60-70%). Также к усилению антипролиферативной активности приводили замены остатков 74 и 76, локализованные в «голове» нейропептида (ингибирование пролиферации 55 и 80%, соответственно). Было установлено, что действие мутантных вариантов SLURP-1 с заменами R74A и L76A было связано с индукцией апоптоза. Для SLURP-2 было показано, что мутации во второй и третьей петлях, а также в «голове» нейропептида приводят к «переключению» активности, стимулирующей рост клеток, на антипролиферативную активность нейропептида. Наиболее выраженная антипролиферативная активность наблюдалась для мутантов с заменами в третьей петле (D52A, Y61A, ингибирование роста клеток на ~ 30%). По данным сайт-направленного мутагенеза и функциональным тестам проведено уточнение моделей комплексов SLURP-1/nAChR и SLURP-2/nAChR. Методами молекулярного моделирования показано, что SLURP-1 также как и Lynx1 (показано ранее, Lyukmanova et al, JBC, 2011) взаимодействует с внешней стороной петли С рецептора, прикрывающей ортостерический сайт, без проникновения в лиганд-связывающий сайт. Это находится в согласии с данными, показывающими отсутствие конкуренции SLURP-1 с а-бунгаротоксином (Lyukmanova et al, PLOS One, 2016, данные получены в рамках выполнения Проекта-2014). При этом петля С находится в положении, прижатой к оси рецептора и соответствующем положению петли в комплексах с агонистами. Напротив, в уточненной модели комплекса SLURP-2/nAChR нейропептид взаимодействует с рецептором, формируя множественные контакты между своими второй и третьей петлями и ортостерическим сайтом рецептора, помещая петли под петлю С рецептора. Положение петли С основной субъединицы рецептора соответствует «открытой» конформации ортостерического сайта. При этом, нейропептид не проникает глубоко в лиганд-связывающий сайт, оставляя возможность для одновременного взаимодействия агониста ацетилхолина с рецептором. Это отличается от ситуации с WTX («слабый» токсин из яда кобры Naja oxiana), когда нейротоксин настолько глубоко проникает в лиганд-связывающий сайт, что места для агониста в кармане уже не остается (моделирование комплекса токсин/рецептор выполнено на третьем этапе проекта). Но все же сравнение модели SLURP-2/nAChR с моделью WTX/nAChR в целом указывает на схожую картину взаимодействия токсина и SLURP-2 с рецептором. В обоих случаях центральная петля нейропептидов образует множественные контакты с ортостерическим сайтом рецептора. Проведено исследование влияния нейропептидов Lynx1, SLURP-1 и SLURP-2 на пролиферацию клеток легочной карциномы человека линии А549. Было показано, что Lynx1 и SLURP-1 значительно ингибируют рост опухолевых клеток (на 17% и 35%, соответственно), а SLURP-2 наоборот стимулирует рост клеток на ~40% при концентрации 1 мкМ и инкубации с клетками в течение 48 часов. Исследовано влияние нейропептидов SLURP-1 и SLURP-2 на пролиферацию клеток эпидермоидной карциномы человека линии А431. Показали, что в этих клетках экспрессируются многие субъединицы nAChR (а1, а3, а4, а7, а9, а10). Исследование влияния SLURP-1 и SLURP-2 на пролиферацию клеток А431 показало, что оба нейропептида значительно ингибируют рост опухолевых клеток (на 28% и 33%, соответственно) при концентрации 0,1 нМ и инкубации с клетками в течение 24 часов. Были получены дозозависимые кривые ингибирования SLURP-1 и SLURP-2 с EC50 ~ 10 pM и 1 pM, соответственно. Ранее в рамках выполнения второго этапа проекта нами было показано, что SLURP-1 ингибирует рост нормальных кератиноцитов с EC50 ~ 4 nM. Таким образом, нейропептиды ингибируют пролиферацию опухолевых клеток в концентрациях, на несколько порядков меньших, чем пролиферацию нормальных клеток. Исследование влияния различных лигандов на взаимодействие нейропептидов Lynx1 и SLURP-2 с а7-nAChR, выделенными из мозга крысы с помощью магнитных частиц, с иммобилизованным на их поверхности нейропептидами, показало, что SLURP-2 конкурирует с а-бунгаротоксином, а Lynx1 с MLA за связывание с а7 субъединицей. Кроме того, в рамках выполнения третьего этапа проекта решены не поставленные ранее задачи: анализ эффективности ренатурации различных нейропептидов семейства Ly6/uPAR (на примере SLURP-1, SLURP-2, Lynx1, WTX, цитотоксина I и мамбалгина-2) при использовании разработанной нами системы бактериальной продукции. Было обнаружено, что эффективность ренатурации зависит от индивидуальных особенностей трехпетельного белка: от количества остатков пролина в третьей петле и площади поверхности заглубленных гидрофобных остатков. Второй незапланированной ранее задачей было построение моделей комплексов mAChR с SLURP-2 и Lynx1, что позволило провести сравнение и выявить общие и отличительные черты между этими нейропептидами человека и токсином кобры WTX. Для токсина в комплексе с рецептором М3 типа на втором этапе выполнения проекта было показано, что центральная петля WTX не закрывает вход в ортостерический сайт, расположенный чуть ниже аллостерического сайта. Слабый комплекс WTX/M3-mAChR стабилизирован главным образом ионными взаимодействиями между положительно заряженными остатками петли II токсина и отрицательно заряженными фрагментами петель ECL2 и ECL3 рецептора. Напротив, для токсина в комплексе с M1-mAChR наблюдалось погружение наиболее длинной петли II в аллостерический лиганд-связывающий вестибюль рецептора М1 типа, расположенный чуть выше ортостерического лиганд-связывающего сайта, таким образом закрывая вход в последний (в рамках выполнения второго этапа проекта). Для моделей комплексов SLURP-2/M3-mAChR и Lynx1/M3-mAChR наблюдалась схожесть первой модели с моделью WTX/M1-mAChR и схожесть второй модели с моделью WTX/M3-mAChR. SLURP-2 «закрывал» вход в лиганд-связывающий вестибюль с помощью второй и третьей петель, затрудняя взаимодействие ортостерических лигандов с рецептором. Напротив, Lynx1 в построенной модели не препятствует взаимодействию метил-скополамина с рецептором, располагаясь в стороне от лиганд-связывающего вестибюля. При этом взаимодействует Lynx1 с рецептором посредством первой и второй петель из положения, допускающего его мембраносвязанное состояние, которое наблюдается в природе из-за наличия GPI-якоря. Полученные данные согласуются с наблюдаемой «положительной» и «отрицательной» аллостерией взаимодействия Lynx1 и SLURP-2 с M3-mAChR, соответственно. Проведен сравнительный анализ полученных данных и предложено описание механизмов действия эндогенных нейропептидов. Полученные данные позволяют рассматривать SLURP-1 и его мутантные варианты с заменами в положениях 74 и 76 в качестве перспективных пептидов для дальнейших новых прикладных разработок в области таргетной терапии рака. Данные, описывающие значительное увеличение пролиферативной активности SLURP-2 при прединкубации клеток с а-бунгаротоксином, позволяют рассматривать этот нейропептид в комбинации с а-бунгаротоксином как перспективный ранозаживляющий препарат. Селективный «priming» эффект, наблюдаемый для SLURP-2 в низких концентрациях на а7-nAChR и приводящий к 5ти кратному увеличению ацетилхолин-индуцированного тока через канал рецептора, указывает на перспективность использования этого нейропептида для разработок в области новых препаратов для улучшения когнитивных функций. Таким образом, выполнение Проекта 2014 позволило получить не только новые научные знания о нейропептидах человека Lynx1, SLURP-1, SLURP-2, но и результаты, имеющие практическую ценность для дальнейших разработок области биотехнологии, фармакологии и биомедицины. В 2016 году по результатам выполнения проекта было опубликовано 5 статей в международных рецензируемых журналах, индексируемых в базах данных «Сеть науки» (Web of Science Сore Сollection).

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".