|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Разработка информационной системы по анатомии и морфологии растений в целях идентификации объектов растительного происхождения для фундаментальных и прикладных исследованийНИР
.
- Руководитель НИР: Северова Е.Э.
- Участники НИР: Авраамова О.Д., Волкова О.А., Девятов А.Г., Майоров С.Р., Нилова М.В., Платонова А.Г., Полевова С.В., Рудько А.И., Филин В.Р., Фырнин Д.М.
- Подразделение: Кафедра высших растений
- Срок исполнения: 22 апреля 2015 г. - 30 августа 2018 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 15-29-02508офи_м
- Номер ЦИТИС: 115042240027
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Общая биология и экология
- ПН России: Науки о жизни
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.29.01 Общие вопросы
-
Ключевые слова:
палинология, древесина, высшие растения, интернет-ресурс, цифровые коллекции, карпология, анатомия
internet resorce, carpology, higher plants, palynology, wood anatomy, digital collections -
Описание:
Идентификация объектов растительного происхождения – задача, актуальная для решения многих фундаментальных и прикладных проблем. Она лежит в основе реконструкций растительности и климата прошлого, широко используется в археологических и экологических исследованиях, при изучении динамики антропогенной нагрузки на естественные экосистемы, для решения вопросов систематики и филогении таксонов различного ранга, успешно используется в экспертных исследованиях, при реставрации памятников культуры, для экспертиз произведений искусства и продуктов питания, в семеноведении, в аллергологии и иммунологии. Все эти исследования не могут быть реализованы без опоры на обширные референсные коллекции, позволяющие максимально точно идентифицировать растительные объекты и охватывающие как большие территории, так и широкий спектр видов. Создание комплексных информационных систем, сочетающих в себе несколько коллекций, взаимно дополняющих друг друга, позволяет проводить экспертные и фундаментальные исследования на новом качественном уровне. Задача проекта – провести на современном уровне оцифровку трех коллекций (палинологической, карпологической и коллекции анатомических срезов и образцов древесины), с объединением их в общую компьютерную информационную систему, снабженную оригинальными текстовыми описаниями и оптимизированной под проведение экспертных исследований системой поиска и сравнения данных. Оцифрованные коллекции будут включать в себя микроскопические изображения анатомических препаратов древесины и ацетолизированных пыльцевых зерен на разных увеличениях и в разных проекциях и нативные изображения семян и плодов. Изображения будут снабжены морфологическими описаниями и морфометрическими данными.
-
Основные результаты:
Созданы цифровая база данных и информационная система идентификации растительных объектов на основе карпологических, палинологических и анатомических данных, объединяющие обширные референсные коллекции кафедры высших растений биологического факультета МГУ. По итогам работы за три года общее наполнение базы данных составило: 2931 вид растений из 141 семейства, 1002 образца палинологической коллекции, 400 образцов коллекции по анатомии древесины, 2000 образцов карпологической коллекции.
- Добавил в систему: Северова Елена Эрастовна
Источник финансирования НИР
| грант РФФИ |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 22 апреля 2015 г.-31 декабря 2015 г. | Разработка информационной системы по анатомии и морфологии растений в целях идентификации объектов растительного происхождения для фундаментальных и прикладных исследований |
| Результаты этапа: | ||
| 2 | 1 января 2016 г.-31 декабря 2016 г. | Разработка информационной системы по анатомии и морфологии растений в целях идентификации объектов растительного происхождения для фундаментальных и прикладных исследований |
| Результаты этапа: На втором этапе НИР Было проведено тестирование административного и пользовательского интерфейса, создание англоязычной версии сайта, разработка системы резервного копирования информации. По итогам двух этапов наполнение базы данных составляет: Палинологическая коллекция - 600 видов Коллекция по анатомии древесины - 250 видов Карпологическая коллекция - 1000 видов | ||
| 3 | 30 августа 2017 г.-30 августа 2018 г. | Разработка информационной системы по анатомии и морфологии растений в целях идентификации объектов растительного происхождения для фундаментальных и прикладных исследований |
| Результаты этапа: Созданы цифровая база данных и информационная система идентификации растительных объектов на основе карпологических, палинологических и анатомических данных, объединяющие обширные референсные коллекции кафедры высших растений биологического факультета МГУ. По итогам работы за три года общее наполнение базы данных составило: 2931 вид растений из 141 семейства, 1002 образца палинологической коллекции, 400 образцов коллекции по анатомии древесины, 2000 образцов карпологической коллекции. В 2018 году было оцифровано 402 вида палинологической коллекции, 150 видов коллекции по анатомии древесины и 1000 видов карпологической коллекции. Информационная система, развернутой в виде веб-сайта над базой данных и размещенная в открытом доступе в сети Интернет (botany-collection.bio.msu.ru), включает в себя три блока, соответствующих трем коллекциям: "Пыльца/споры" (палинологическая коллекция), "Древесина" (коллекция по анатомии древесины) и "Плоды и семена" (карпологическая коллекция). Система имеет общий интерактивный каталог всех введенных в систему образцов с функцией поиска по названиям родов, видов, семейств и жизненным формам. Каждая коллекция имеет отдельный каталог образцов с функциями поиска по различным параметрам в зависимости от особенностей материала. Разработана английская версия системы. В 2018 году была добавлена функция алфавитного поиска по названию рода как по всей базе данных, так и внутри каждого блока, расширена структура базы данных в части, относящейся к предметной области, изменен пользовательский интерфейс (добавлены возможности выбора количества записей на странице, сортировки по колонкам, система поиска учитывает не только валидные названия таксонов, но и синонимы, появилась возможность открывать образцы «в новой вкладке», улучшена постраничная навигация), дополнены каталоги всех коллекций, размещенные на сайте в виде файлов Exсel. | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".