Конформационная подвижность нуклеосомы: исследование методом молекулярной динамики

Армеев, Г.А.; Шайтан, К.В.; Шайтан, А.К.

Авторы: Армеев Г.А., Шайтан К.В., Шайтан А.К.
Журнал: Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
Номер: 3
Год издания: 2015
Издательство: Изд-во Моск. ун-та
Местоположение издательства: М.
Первая страница: 49
Последняя страница: 54
Аннотация: Исследование принципов работы хроматина – одна из краеугольных задач молекулярной биологии, связанная с пониманием процессов эпигенетической регуляции экспрессии генов, репарации ДНК, механизмов наследственности. Элементарной единицей организации хроматина является нуклеосома – комплекс ДНК и белков гистонов. Структура нуклеосомы, полученная методами рентгеновской кристаллографии, некоторое время рассматривалась как конечное основное конформационное состояние нуклеосомы, однако все больше экспериментальных данных указывают на то, что конформационный полиморфизм и динамика нуклеосом широко вовлечены в функционирование хроматина. Тем не менее отсутствует детальное понимание конформационной динамики нуклеосом на атомистическом уровне. В данной работе мы подошли к решению этой задачи путем проведения моделирования нуклеосомы методом молекулярной динамики в явном растворителе. Исследовалась динамика нуклеосомы на временном промежутке 500 нс. Произведен ковариационный анализ траектории молекулярной динамики системы с последующим исследованием обнаруженных коллективных движений. Изучено распределение молекул воды в системе, предполагается роль внутринуклеосомальной воды. Ключевые слова: нуклеосома, хроматин, молекулярная динамика, эпигенетика
Добавил в систему: Шайтан Константин Вольдемарович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ФНКЦ РР
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ФНКЦ РР

Конформационная подвижность нуклеосомы: исследование методом молекулярной динамикистатья

Прикрепленные файлы