Характеристика эндонуклеазной функции белка MutL из системы репарации «мисматчей» Rhodobacter sphaeroidesстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 24 января 2020 г.
Аннотация:Впервые выделен белок MutL – компонент системы репарации некомплементарных пар нуклеотидов избактерии Rhodobacter sphaeroides (rsMutL) и продемонстрирована его эндонуклеазная активность, предсказанная биоинформатическими методами. На основе «выравнивания» 1483 последовательностей бактериальных гомологов MutL с предполагаемой эндонуклеазной активностью проведена оценка степени консервативности функционально значимых мотивов и отдельных аминокислотных остатков. В С-концевом доме не rsMutL идентифицированы 5 мотивов, формирующих каталитический центр белка, ответственный загидролиз ДНК. Выявлено 7 консервативных мотивов, образующих участок связывания ATP и характерныхдля ATPаз семейства GHKL. Показано, что MutL из R. sphaeroides (rsMutL) наиболее эффективно гидролизует плазмидную ДНК в присутствии ионов Mn2+. Степень расщепления ДНК уменьшается в рядуMn2+ > Co2+ > Mg2+ > Cd2+. Ионы Ni2+ и Ca2+ практически не стимулируют эндонуклеазную функцию MutL.Наличие ионов Zn2+ подавляет гидролиз плазмидной ДНК белком rsMutL в присутствии избытка Mn2+. Показано, что присутствие ATP значительно ингибирует способность rsMutL расщеплять ДНК. На основаниианализа данных для всех 5 изученных бактериальных MutL, обладающих эндонуклеазной функцией, показано, что наибольшее сходство как по первичной структуре, так и по биохимическим свойствам, MutL из R. sphaeroides демонстрирует по отношению к MutL из N. gonorrhoeae и P. aeruginosa.