|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Comparative analysis of the complete plastomes of garlic Allium sativum and bulb onion Allium cepaстатья
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 26 декабря 2018 г.
- Авторы: Filyushin M.A., Mazur A.M., Shchennikova A.V., Kochieva E.Z.
- Журнал: Vavilov Journal of Genetics and Breeding
- Том: 22
- Номер: 5
- Год издания: 2018
- Первая страница: 524
- Последняя страница: 530
- DOI: 10.18699/vj18.390
- Аннотация: Секвенирование и сравнительная характеристика пластидных геномов растений – актуальный инструмент для современных филогенетических и таксономических исследований. Род Allium L. (сем. Amaryllidaceae) объединяет более 900 видов растений, включая такие экономически значимые овощные культуры, как чеснок Allium sativum, лук репчатый Allium cepa, лук-порей A. porrum и др. В настоящей работе впервые определена полная нуклеотидная последовательность пластидного генома чеснока A. sativum. Пластом A. sativum имел размер 153172 п. н. и состоял из большой уникальной (LSC, 82035 п. н.) и малой уникальной (SSC, 18015 п. н.) копий, разделенных инвертированными повторами (IRa и IRb) размером 26561 п. н. каждый. В пластидном геноме чеснока аннотировано 134 гена, из них 82 белок-кодирующих, 38 тРНК, 8 рРНК и 6 псевдогенов. Сравнительный анализ пластидных геномов A. sativum и A. cepa выявил различия в размерах структурных элементов и спейсеров на границах инвертированных повторов. Общее число генов в пластомах A. sativum и A. cepa было одинаковым, однако генный состав различался: ген rpl22 был функциональным у A. sativum и псевдогеном у A. cepa, а ген rps16 – наоборот, псевдогеном у A. sativum и белок-кодирующим у A. cepa. В последовательностях пластидных геномов чеснока A. sativum и лука репчатого A. cepa были идентифицированы 32 микросателлитные последовательности, больше половины которых – динуклеотидные, остальные – тетра-, пента- и гексануклеотидные, а тринуклеотидные отсутствовали. Сравниваемые пластидные геномы отличались числом повторов ряда микросателлитов, а некоторые микросателлиты встречались только у одного из видов.
- Добавил в систему: Филюшин Михаил Александрович