Исследование аллостерического эффекта 2,8-диметилирования A2503 23S рРНК E. coli методом молекулярно-динамического моделирования

Макарова, Т.М.; Макаров, Г.И.

Авторы: Макарова Т.М., Макаров Г.И.
Журнал: Биохимия
Том: 85
Номер: 11
Год издания: 2020
Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
Местоположение издательства: Москва
Первая страница: 1718
Последняя страница: 1728
Аннотация: Рибосома – это молекулярная машина, синтезирующая все клеточные белки. Она также является мишенью около половины клинически используемых антибиотиков. Один из способов защиты от антибиотиков заключается в адаптивной химической модификации остатков рибосомальных РНК. Любопытным примером такой модификации служит 2,8-диметилирование А2503 23S рРНК, вызывающее устойчивость к фениколам, линкозамидам, оксазолидинонам, плевромутилинам и некоторым макролидам. В настоящей работе методом молекулярно-динамического моделирования исследовалось, как 2,8-диметилирование A2503 влияет на конформации и подвижность нуклеотидных остатков 70S рибосом Escherichia coli. Значительные изменения были выявлены как в непосредственном окружении остатка А2503 23S рРНК, так и глубже в рибосомном туннеле (РТ) среди остатков, о которых известно, что они вовлечены в процесс передачи сигнала от антибиотиков, связывающихся в РТ, к пептидилтрансферазному центру. Эти изменения смещают рибосому в сторону состояния А/А,Р/Р из конформационно иного состояния, в нашем примере – это состояние Р/Р,Е/Е. Это позволяет заключить, что эффект модификации m2m8A2503 состоит в дополнительной стабилизации состояния А/А,Р/Р, способствующего пептидилтрансферазной реакции (ПТР) в противоположность действию антибиотиков – ингибиторов ПТР.
Добавил в систему: Макаров Геннадий Иванович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ФНКЦ РР
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ФНКЦ РР

Исследование аллостерического эффекта 2,8-диметилирования A2503 23S рРНК E. coli методом молекулярно-динамического моделированиястатья Исследовательская статья

Прикрепленные файлы