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Variabilidad genética del espaciador intergénico psbA-trnH en Amaranthus L. (Amaranthaceae)статья
- Авторы: Carlos Torres –.Miño, Slugina M.A., Filyushin M.A., Rafael Hernández Maqueda
- Журнал: La revista UTCiencia de la Universidad Técnica de Cotopaxi
- Том: 2
- Номер: 2
- Год издания: 2015
- Первая страница: 72
- Последняя страница: 78
- Аннотация: Resumen En el presente trabajo se analizó la secuencia psbA-trnH de 16 muestras de Amaranthus (A. flavus, A. aureus, A. gangeticus, A. floridanus, A. hypochondriacus A. giganteus, A. mantegazzianus, A. bouchonii, A. mangostanus, A. oleraceus, A. tricolor, A. cruentus, A. hybridus, A. caudatus) para determinar la variabilidad genética. La región estudiada se caracterizó por tener un bajo nivel de polimorfismo (2,36% de las bases nucleotídicas). Se detectó la presencia de polimorfismos de nucleótido simple (en adelante, SNPs) e indeles. La especie silvestre A. gangeticus presentó la mayor variabilidad (2 haplotipos). Se describen, por primera vez 11 haplotipos de especies silvestres y cultivadas de Amaranthus. Es necesario explorar otro tipo de marcadores moleculares (AFLP, SSR, RAPD) que podrían ser más resolutivos para resolver cuestiones taxonómicas y filogenéticas dentro del género. Palabras clave: Amaranthus, espaciador intergénico, polimorfismo genético, cebador. Abstract In this study we analyzed the plastid region psbA-trnH of 16 Amaranthus (A. flavus, A. aureus, A. gangeticus, A. floridanus, A. hypochondriacus A. giganteus, A. mantegazzianus, A. bouchonii, A. mangostanus, A. oleraceus, A. tricolor, A. cruentus, A. hybridus, A. caudatus) in order to determinate genetic variability. The region studied resulted in a low polymorphism level (2,36% of the nucleotide bases). Simple Nucleoite Polymorphism (hence forth SNPs) and indels were detected. The wild species A. gangeticus showed the highest genetic variability (2 haplotypes). 11 haplotypes were described for the first time for both cultivated and wild species of Amaranthus. Other molecular markers such as AFLP, SSR, RAPD must be explored to resolve the taxonomic and phylogenetic problems within the genus. Keywords: Amaranthus, intergenic spacer, genetic polymorphism, primer.
- Добавил в систему: Слугина Мария Андреевна