|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Histone dynamics mediate DNA unwrapping and sliding in nucleosomesстатья Исследовательская статья
Статья опубликована в высокорейтинговом журнале
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 7 июля 2021 г.
- Авторы: Armeev Grigoriy A., Kniazeva Anastasiia S., Komarova Galina A., Kirpichnikov Mikhail P., Shaytan Alexey K.
- Журнал: Nature communications
- Том: 12
- Номер: 1
- Год издания: 2021
- Издательство: Nature Pub. Group
- Местоположение издательства: United Kingdom
- Первая страница: 1
- Последняя страница: 15
- Номер статьи: 2387
- DOI: 10.1038/s41467-021-22636-9
- Аннотация: Nucleosomes are elementary building blocks of chromatin in eukaryotes. They tightly wrap ∼147 DNA base pairs around an octamer of histone proteins. How nucleosome structural dynamics affect genome functioning is not completely clear. Here we report all-atom molecular dynamics simulations of nucleosome core particles at a timescale of 15 micro- seconds. At this timescale, functional modes of nucleosome dynamics such as spontaneous nucleosomal DNA breathing, unwrapping, twisting, and sliding were observed. We identified atomistic mechanisms of these processes by analyzing the accompanying structural rear- rangements of the histone octamer and histone-DNA contacts. Octamer dynamics and plasticity were found to enable DNA unwrapping and sliding. Through multi-scale modeling, we showed that nucleosomal DNA dynamics contribute to significant conformational variability of the chromatin fiber at the supranucleosomal level. Our study further supports mechanistic coupling between fine details of histone dynamics and chromatin functioning, provides a framework for understanding the effects of various chromatin modifications.
- Добавил в систему: Шайтан Алексей Константинович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | s41467-021-22636-9.pdf | 6,5 МБ | 29 сентября 2022 [kniazeva.anastasiia] |