|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Использование генов ферментов углеродного метаболизма в качестве молекулярных маркеров для представителей филума c Chlorobiстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАКСтатья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 4 марта 2022 г.
- Авторы: Турова Т.П., Ковалева О.Л., Горленко В.М., Ивановский Р.Н.
- Журнал: Микробиология
- Том: 83
- Номер: 1
- Год издания: 2014
- Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 1
- Последняя страница: 12
- DOI: 10.7868/S0026365614010157
- Аннотация: Исследовалась возможность использования некоторых генов ферментов углеродного метаболизма в качестве молекулярных маркеров для изучения филогении и экологии зеленых серных бактерий (ЗСБ) филума Chlorobi. Сконструированные праймеры для амплификации генов АТФцитратлиазы (aclB) и цитратсинтазы (gltA) выявили соответствующие гены в геномах всех вновь изученных штаммов ЗСБ. При этом филогенетические деревья, основанные на анализе нуклеотидных и аминокислотныхпоследовательностей данных генов, были в основном конгруэнтны соответствующему дереву, основанному на анализе генов 16S рРНК, за единственным исключением: на GltA-дереве типовой штамм Chloroherpeton thalassium образовывал отдельную ветвь вне кластера остальных представителей филума Chlorobi. Это свидетельствовало о озможности получения праймеров, избирательно специфичных для всех представителей филума Chlorobi, только для генов aclB. Поэтому именно этот ген был использован в качестве олекулярного маркера для детекции ЗСБ в образцах акопительных культур и природных проб. AclB-филотипы зеленых серных бактерий были выявлены во всех изученных образцах, кроме природных проб, полученных из содовых озер. При этом идентификация выявленных филотипов соответствовала полученной при спользовании известного специфичного для филума Chlorobi молекулярного маркера – гена FMO-елка (fmo)
- Добавил в систему: Ивановский Руслан Николаевич