|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Изучение функций CRE-кармана бактериальной РНК-полимеразы в системах in vitro и in vivo. Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков Россиитезисы доклада Тезисы
- Авторы: Петушков И.В., Пупов Д.В., Кульбачинский А.В.
- Сборник: Научные труды V Съезда физиологов СНГ V Съезда биохимиков России Конференции ADFLIM, ACTA NATURAE
- Серия: СПЕЦВЫПУСК
- Том: 2
- Тезисы
- Год издания: 2016
- Место издания: Acta Naturae, ООО «Парк-медиа»
- Первая страница: 49
- Последняя страница: 49
- Аннотация: Бактериальная РНК-полимераза (РНКП) для узнавания промоторов использует специальную сигма-субъединицу, которая образует специфические контакты с промоторной ДНК. Однако, современные структурные исследования показали, что оста-ток гуанина в +2 положении промотора (+2G) может образовывать специфические контакты с так называемым CRE-карманом (от англ. core recognition element) бета-субъединицы РНКП. Роль таких контактов в транскрипции остаѐтся неяс-ной. Цель работы: методами транскрипции in vitro и с помощью экспрессии репортерных конструкций in vivo выявить воз-можную роль этих контактов на разных стадиях транскрипции. Мы показали, что наличие остатка +2G приводит к стабили-зации промоторных комплексов РНКП, а также влияет на синтез коротких РНК-продуктов в процессе абортивной инициа-ции. Мутации остатков РНКП, контактирующих с +2G, снижают стабильность промоторного комплекса и влияют на эффек-тивность ухода РНКП с промотора. Мутации в исследуемом районе также оказывают влияние на скорость элонгациии на продолжительность транскрипционных пауз, за счѐт нарушения узнавания остатка +1G в сигнале паузы, причем структура синтезируемой РНК способна модулировать узнавание данного остатка при формировании пауз. Кроме того, точечные заме-ны и делеции в CRE-кармане приводят к нарушениям терминации транскрипции, предположительно, за счѐт влияния на формирование паузы в участке терминатора. Таким образом, полученные результаты указывают на важную роль контактов CRE-кармана РНКП с ДНК на всех стадиях транскрипции. Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ № 16-34-00824.
- Добавил в систему: Петушков Иван Владимирович