Аннотация:Исследование белков является одной из важных современных задач биологии.При решении многих задач биоинформатики возникает необходимость по задан-ной структуре белка определить структурно схожие с этим белком известныебелки. Поиск схожих по трехмерной структуре известных белков помогает по-нять функции белка. В работе предлагается нейросетевой метод сранительногоанализа структур заданнной пары белков. Предложенный метод позволяет быст-ро отобрать в базе данных структур потенциально схожие по структурам бел-ки. В работе обсуждаются архитектура и параметры предложенной нейросетии предлагается метод выделения признаков рассматриваемых структур. Обуче-ние нейросети предлагается проводить с использованием имеющихся баз данныхс выделенными доменами структурно похожих белков. В качестве решения дляобучения нейросети предлагается использовать базу данных доменов CATH S40.Рассматривается метод перевода трехмерной структуры белка в вектор призна-ков при помощи анализа расстояний между парами центральных атомов амино-кислот. Предлагается несколько вариантов предложенного подхода. Приводятсярезультаты экспериментального исследования разработанного метода