Аннотация:Для изучения структурных особенностей остановленных элонгационных комплексов (ЭК), формирующихся в ходе транскрипции нуклеосом РНК-полимеразой 2 (РНКП 2), предложено использовать подход, основанный на измерении эффективности Фёрстеровского резонансного переноса энергии (FRET, Förster resonance energy transfer) в полиакриламидном геле после разделения интермедиатов транскрипции методом электрофореза. Флуоресцентно-меченые нуклеосомы были получены путем введения пары флуорофоров (донора и акцептора) в соседние супервитки нуклеосомной ДНК. Остановленные ЭК формировали, проводя транскрипцию нуклеосом в присутствии ограниченного набора нуклеозидтрифосфатов. Сравнительный анализ эффективности FRET для свободных нуклеосом и полученных на их основе ЭК с РНКП 2 выявил изменение структуры нуклеосом в составе ЭК. Показано, что ЭК с одинаковой длиной РНК могут существовать в различных конформационных состояниях.