Генетический код: взаимодействие аминокислот белков (фрагментов, пептидов) в соответствии с различными правилами, принципами, кодами. Правило исключенийстатьяИсследовательская статья
Аннотация:Проблема белок-белкового взаимодействия рассматривается для целого ряда структур: лиганд-рецептор, антиген-антитело; фолдирующих в различные вторичные и третичные структуры . Учитывается роль отдельной АК при этом взаимодействии – в том числе по соседству, при точечных и так называемых симметричных мутациях, а так же при двойных и комбинационных заменах. Также учитывается вклад некоторых структурных мотивов в поддержание аффинного и специфического видов взаимодействия и способность к сохранению (либо, наоборот, резкой утрате) эквифункциональности взаимодействующих белковых участков. Во взаимодействие, кроме стандартных структур, могут вовлекаться стереохимические, оптические изомеры, аналоги и ретроаналоги, а также типологически эквивалентные взаимодействующие белковые фрагменты. Рассмотрение белок-белковых взаимодействий перечисленных типов интересно, в том числе, и с точки зрения связи их с целой структурой, характером и особенностями самого генетического кода. Последнему присущи так называемые симметрия (включая скрытую), асимметрия, различные виды комплементарностей: сенс-антисенс, гидропатическая, корневая (по 2 основанию кодона), и др.
