|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Молекулярное моделирование активации цефтриаксона в активных центрах пенициллин-связывающих белков 2статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК- Авторы: Кривицкая А.В., Хренова М.Г.
- Журнал: Известия Академии наук. Серия химическая
- Номер: 5
- Год издания: 2022
- Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 915
- Последняя страница: 920
- Аннотация: Методом молекулярной динамики с потенциалами комбинированного методаквантовой механики/молекулярной механики проведено моделирование ферментсубстратных комплексов пенициллин-связывающих белков 2 из штаммов FA19,35/02 и H041 Nisseria gonorrhoeae c цефтриаксоном. Рассмотрены длины водородныхсвязей между карбонильным атомом кислорода субстрата и аминокислотными остатками оксианионного центра, а также расстояния нуклеофильной атаки атомом кислорода каталитического серина карбонильного атома углерода субстрата. Согласнорезультатам анализа двумерных карт лапласиана электронной плотности для дикого типа происходит более эффективная активация субстрата ферментом, что согласуется с геометрическими характеристиками: распределением длин водородных связей в оксианионном центре и расстоянием нуклеофильной атаки, которые смещены в сторону меньших значений.
- Добавил в систему: Хренова Мария Григорьевна
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|