ПОЛИМОРФИЗМ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ГЕНОВ KPI-A ИЗ КАРТОФЕЛЯ ПОДРОДА Pоtаtое (sect Petota, Estolonifera И Lycopersicum) И ПОДРОДА Solanumстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 28 мая 2015 г.
Аннотация:Белки KPI группы А участвуют в защите растений картофеля от патогенных микроорганизмов и вредителей. Хотя в настоящее время известны последовательности достаточно большого числа генов KPI-А из различных сортов культурного картофеля (Solanum tuberosum subsp. tuberosum) и некоторого числа сортов томатов (Solanum lycopersicum), информации об аллельном разнообразии этих генов в других видах рода Solanum нет. Посредством клонирования, амплификации, секвенирования и последующего анализа в нашей работе впервые установлены консенсусные последовательности фрагментов генов KPI-A из растений подрода Potatoe секция Petota (Solanum tuberosum ssp. andigenum – пять генов и Solanum stoloniferum – два гена) и из подрода Solanum (Solanum nigrum – пять генов). Все эти последовательности и последовательности генов представителей секции Petota (культурного картофеля Solanum tuberosum ssp. tuberosum) и секции Etuberosum (S. palustre) сходны на 97–100%. Межвидовая вариабельность этих генов не превышает внутривидовую, за исключением последовательностей из S. lycopersicum, а распределение высоковариабельных и консервативных областей в кодирующей зрелый белок области генов одинаково у генов всех вышеперечисленных видов. В то же время, при использовании тех же праймеров на ДНК Solanum dulcamara, S. lycopersicum и Mandragora officinarum не обнаруживается идентичных последовательностей гомологичных генов. Филогенетический анализ по гену KPI-А показал, что последовательности из S. lycopersicum образуют независимый от прочих изученных видов кластер, тогда как S. nigrum попадает в кластер, единый с видами sect. Etuberosum и Petota, и перечисленные виды не образуют видоспецифичных субкластеров. Несмотря на то, что растения S. nigrum устойчивы ко всем известным расам оомицета Phytophthora infestans, возбудителя наиболее опасного заболевания пасленовых, последовательности аминокислот, кодируемые генами KPI-A из генома этого вида практически или вовсе не отличаются от белков этой же группы, которые характерны для поражаемых P. infestans растений культурного картофеля.