|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Биочип для определения полигенного риска развития болезни Альцгеймератезисы доклада
- Авторы: Федосеева Е.Д., Иконникова А.Ю., Антонова О.В., Сюняков Т.С., Емельянова М.А., Зоркина Я.А., Абрамова О.В., Андреюк Д.С., Павлов К.А., Савилов В.Б., Соловьёва К.П., Курмышев М.В., Карпенко О.А., Андрюшенко А.В., Костюк Г.П., Морозова А.Ю., Грядунов Д.А.
- Сборник: Мультидисциплинарные аспекты молекулярной медицины. Сборник материалов VI Российского конгресса с международным участием
- Тезисы
- Год издания: 2022
- Издательство: Санкт-Петербургский государственный экономический университет
- Местоположение издательства: Санкт-Петербург
- Первая страница: 160
- Последняя страница: 162
- Аннотация: Введение. Патогенез болезни Альцгеймера (БА) связан как с триггерными факторами окружающей среды, так и с генетической предрасположенностью. Наиболее важным и изученным генетическим маркером является аллель ε4 гена аполипопротеина Е (АРОЕ), который увеличивает риск развития заболевания в несколько раз. Однако наличие этого маркера может объяснить далеко не все случаи развития БА. В ходе масштабных полногеномных ассоциативных исследований выявлено множество однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), ассоциированных с БА. Тем не менее, за счет небольшой величины эффекта отдельных SNP существуют сложности с воспроизводимостью результатов, и возможность их использования как самостоятельных факторов риска ограничена. Перспективным подходом в изучении генетики БА является оценка полигенного риска (ПГР). Модели ПГР учитывают оценку суммарного влияния совокупности SNP. Наиболее изученными для БА являются модели, включающие 21 [1] и 31 SNP [2]. Выявлена взаимосвязь ПГР с динамикой комбинированных когнитивно-функциональных показателей, отложение амилоида и тау-белка, нейродегенерацией и другими процессами. В зарубежных исследованиях для определения ПГР используют дорогостоящие и трудоёмкие методы на основе микрочипов высокой плотности или высокопроизводительного секвенирования. Для апробации ПГР на образцах пациентов российской популяции нами использована успешно зарекомендовавшая себя в клинической диагностике технология гидрогелевых биочипов, которая позволяет быстро и эффективно осуществлять многопараметрический анализ генома с использованием ограниченного специализированного набора молекулярных зондов [3]. Цель. Разработка и апробация метода идентификации генетических маркеров для оценки полигенного риска развития БА с использованием гидрогелевых биочипов. Материалы и методы. Процедура анализа включала мультиплексную амплификацию фрагментов генома человека с последующей аллель-специфичной гибридизацией на биочипах с иммобилизованными зондами. Результаты генотипирования выборочно верифицировали методами секвенирования по Сэнгеру, а также ПЦР с детекцией в режиме реального времени с TaqMan зондами и анализом кривых плавления высокого разрешения. Статистический анализ выполняли с помощью онлайн-сервиса SNPStats. Результаты и обсуждение. Разработан биочип, позволяющий анализировать 21 маркер для оценки ПГР - rs6656401, rs6733839, rs35349669, rs190982, rs9271192, rs10948363, rs2718058, rs1476679, rs11771145, rs28834970, rs9331896, rs10838725, rs983392, rs10792832, rs11218343, rs17125944, rs10498633, rs8093731, rs4147929, rs3865444, rs7274581 [1], а также определять ε-аллели гена APOE по полиморфизмам rs429358 и rs7412. Разработанным методом проведено генотипирование коллекции образцов ДНК 85 пациентов с болезнью Альцгеймера и 115 здоровых доноров. Оценка индивидуального вклада изучаемых генетических факторов подтвердила, что наличие аллеля ε4 достоверно связано с риском развития БА (ОШ = 2.7, 95% ДИ = 1.4 - 5, p = 0.0018 для доминантной модели). Для rs10792832, напротив, был показан протективный эффект (ОШ = 0.5, 95% ДИ = 0.3 – 0.86, p = 0.0083 для аддитивной модели). Заключение. Дальнейшая валидация ПГР на основе гидрогелевого биочипа с использованием образцов различных когорт российских пациентов позволит создать и внедрить новый диагностический скрининговый инструмент для оценки риска развития БА.
- Добавил в систему: Костюк Георгий Петрович