СТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ НЕОРГАНИЧЕСКОЙ ПИРОФОСФАТАЗЫ OGATAEA PARAPOLYMORPHA

Безпалая, Е.Ю.; Родина, Е.В.; Курилова, С.А.; Воробьева, Н.Н.

Авторы: Безпалая Е.Ю., Родина Е.В., Курилова С.А., Воробьева Н.Н.
Сборник: 13-ая Международная научная конференция «БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕН- ТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ» (БИОКАТАЛИЗ - 2023), Суздаль, 2023
Тезисы
Год издания: 2023
Место издания: ООО «АДМИРАЛ ПРИНТ» Москва, ул. Барклая, д. 13 стр. 1
Первая страница: 172
Последняя страница: 172
DOI: 10.25998/MSL.2023.78.95.001
Аннотация: Митохондриальная изоформа неорганической пирофосфатазы (РРА2) у дрожжей и человека играет важную роль в аэробном метаболизме [1]. Структура митохондриальных пирофосфатаз пока не решена экспериментально. Настоящая работа направлена на решение актуальной биохимической задачи: выяснения структурных особенностей фермента для понимания принципов его функционирования и регуляции.Основным объектом данной работы является митохондриальная пирофосфатаза дрожжей Ogataea parapolymorpha (ОрРРА2), имеющая высокую схожесть с ферментом человека. Биохимические и структурные исследования показывают, что динамическое поведение ОрРРА2 может играть важную роль в регуляции ее активности. Гомологичным моделированием была получена пространственная структура этого фермента и проведена симуляция молекулярной динамики. Согласно ее результатам, субъединицы димера в растворе принимают различные конформации. Установлено, что диссоциация димера ОрРРА2 на мономеры сопровождается значительным снижением каталитической активности. Симуляция молекулярной динамики мономера и димера ОрРРА2 позволила предположить путь передачи информации из межсубъединичного интерфейса в активный центр. Также структурный анализ позволил найти возможные сайты связывания недавно обнаруженных аллостерических активаторов фермента, NADH и АТP, в молекуле фермента. Однако выдвинутые предположения нуждаются в экспериментальном подтверждении. С этой целью предполагается использовать ЯМР спектроскопию. Этот метод позволит решить структуру фермента, охарактеризовать его динамические свойства, а также экспериментально определить сайты связывания найденных эффекторов. Получение белка, который можно исследовать с помощью ЯМР, состоит из нескольких стадий изотопного мечения. К настоящему моменту мы получили генно-инженерную культуру клеток E. coli, адаптированную к росту в D2O и экспрессирующую ОрРРА2, а также образец белка, меченный 15N и частично меченный дейтерием. Таким образом, результаты расчетной и биохимической части нашей работы позволили выдвинуть предположения о возможных путях регуляции активности Op-PPA2 и структурных особенностях ее работы. Эти предположения планируется проверить с помощью метода ЯМР. Литература1. Kennedy H., Haack T.B., Hartill V., et al. Sudden Cardiac Death Due to Deficiency of the Mitochondrial Inorganic Pyrophosphatase PPA2 // Am J Hum Genet. 2016. Vol. 99(3). P. 674-682.Работа выполнена при финансовой поддержке РНФ, проект № 23-24-00177.
Добавил в систему: Родина Елена Валерьевна

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ФНКЦ РР
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ФНКЦ РР

СТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ НЕОРГАНИЧЕСКОЙ ПИРОФОСФАТАЗЫ OGATAEA PARAPOLYMORPHAтезисы доклада Тезисы

Прикрепленные файлы