Аннотация:Представлена новая технология сравнительной геномной гибридизации на NotI-микрочипах (международный патент Каролинского института WO02/086163). Методика основана на проведении сравнительной гибридизации NotI-обогащенных проб из геномной ДНК опухолевой и нормальной тканей с помощью принципиально новых NotI-микрочипов, на которых иммобилизованы NotI-связующие клоны. Проанализирован 181 NotI-связующий геномный локус из хромосомы 3 человека в 200 образцах злокачественных опухолей различных органов: почек, легких, молочной железы, яичников, шейки матки, предстательной железы. Наиболее часто (более чем в 30% случаев) изменения (делеции и метилирование) идентифицированы в NotI-сайтах, расположенных в локусах MINT24, BHLHB2, RPL15, RARbeta1, ITGA9, RBSP3, VHL, ZIC4, что указывает на их возможную связь с развитием заболевания. Метилирование этих геномных локусов подтверждено с помощью метил-специфичной полимеразной цепной реакции и бисульфитного секвенирования. Полученные результаты указывают на перспективность использования разработанной методики для решении ряда проблем онкогеномики.