|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ФНКЦ РР |
||
Компьютерное моделирование химических реакций в сложных биологических системах: ферментативный гидролиз циклического дигуанозинмонофосфатастатья
- Авторы: Григоренко Б.Л., Князева М.А., Исаева Е.В., Новичкова Д.А., Немухин А.В.
- Журнал: Наноструктуры. Математическая физика и моделирование
- Том: 10
- Номер: 2
- Год издания: 2014
- Первая страница: 95
- Последняя страница: 105
- Аннотация: Компьютерные реализации метода квантовой механики – молекулярной механики (КМ/ММ) позволяют моделировать все более сложные явления в наноразмерных молекулярных системах, включая химические реакции в белках. Иллюстрация возможностей современных приемов моделирования в приближении КМ/ММ дана на примере одной из важнейших биохимической реакций, а именно, реакции гидролиза циклического дигуанозинмонофосфата фосфодиэстеразами - ферментами, регулирующими концентрацию вторичных посредников при передачах сигналов в клетках. Кратко описаны оригинальные алгоритмы варианта КМ/ММ с конформационно-подвижными эффективными фрагментами. Рассчитанные структуры комплексов фермента с субстратом и продуктами реакции сопоставлены с результатами рентгеноструктурного анализа.
- Добавил в систему: Немухин Александр Владимирович