ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ФНКЦ РР |
||
В 2015 г. в рамках темы 01.2006.06934 «Соотношение молекулярно-генетических и фенотипических закономерностей видообразования у млекопитающих» проводилось изучение молекулярной филогенетики, систематики и филогеографии насекомоядных из семейств Soricidae и Talpidae и Erinaceidae. мультигенного анализа ядерной ДНК, а также исследование процессов гибридизации и интрогрессии в подмосковной зоне симпатрии двух видов обыкновенных ежей (Erinaceus europaeus/E. roumanicus), на основе микросателиитного и мультигенного анализа. Кроме того, в отчетном периоде были начаты исследования по филогеографии и внутривидовой таксономии мохноногого тушканчика Dipus sagitta. Основные результаты исследований. 1. Секвенирование фрагментов 5-и ядерных генов и митохондриального гена cytb кротовых трибы Scalopini позволил провести сравнительное филогенетическое исследование кротовых, ведущих строго подземный образ жизни. Получена высокая поддержка монофилии трибы Scalopini, включая S. oweni, и представлены доказательства отсутствия объединения триб Talpini и Scalopini в одной кладе. Полученные данные представляют собой первое молекулярное исследование филогенетического положения ганьсуйского крота Scapanulus oweni. Результаты подчеркивают роль морфологических параллелелизмов как потенциального источника конфликта между филогенетическими реконструкциями, основанными на молекулярных и морфологических данных. 2. В отчетном периоде завершена работа по молекулярной филогенетике и систематике кротов Восточной Азии из трибы Talpini, роды Euroscaptor и Mogera (совместно с асп. Е.Д. Землемеровой). Полученные новые данные по кротам Восточной Азии свидетельствуют о богатом видовом разнообразии родов Euroscaptor и Mogera, требующем таксономической ревизии. На основе молекулярных данных предложена новая система юго-восточной ветви трибы Talpini, учитывающая следующие факты: роды Mogera и Euroscaptor не являются сестринскими; род Euroscaptor не является монофилетическим, т.к. по уровню молекулярно-генетического своеобразия E. mizura соответствует самостоятельному роду; без учета E. mizura род Euroscaptor распадается на две группы, которые, вероятно, заслуживают родового статуса, в частности Euroscaptor s.str. (Южная Азия, включая Китай, Непал, Лаос, Вьетнам, Бирма, Таиланд, п-ов Малайзия) и еще один ранее не описанный род (только Вьетнам); род Euroscaptor s.str. содержит два не описанных ранее криптических вида, в составе нового рода обнаружена генетическая линия, также, вероятно, заслуживающая, ранга вида; подтверждается видовой статус Mogera latouchei; не подтверждается присутствие в южном Приморье Mogera wogura. 3. Продолжено изучение молекулярной систематики землероек. Генотипировано 55 новых образцов Crocidura из Восточной Европы, ЮВ Азии и Эфиопии. Набор полученных ранее данных по 7-и ядерным генам дополнен новыми сиквенсами. В результате сотрудничества с лабораторией эволюционной геномики ФББ МГУ получен транскриптом пегого путорака (Diplomesodon pulchellum) и начата работа по его сборке и аннотированию (совместно с И.В. Артюшиным и В.О. Бурской). 4. Продолжено изучение филогеографии и демографической истории обыкновенной бурозубки (совместно с инж. А.А. Распоповой). Проанализированы последовательности гена cytb у 493 особей Sorex araneus из более чем 100 локалитетов Западной, Восточной Европы и Сибири. Анализ митохондриальных скоростей эволюции указывает на послеледниковую экспансию вида не позднее окончания верхнего дриаса. На территории Сибири это событие происходило в конце пре-бореального – начале бореального периода голоцена, когда активно восстанавливался лесной покров. Расселение в пределах отдельных регионов на территории Европы также происходила в голоценовые времена, причем самой молодой из исследованных оказалась популяция северо-востока Европы. 5. Продолжено изучение процессов гибридизации и интрогрессии в подмосковной зоне симпатрии двух видов обыкновенных ежей (Erinaceus europaeus/E. roumanicus), на основе микросателиитного и мультигенного анализа (совместно с асп. К. Матвеевой). В дополнение к спектрам 6-и микросателлитных локусов для 153 ежей Средней и Южной России, а также Западной Сибири, получены данные еще по 5 локусам. В смешанной популяции Московской области совпадение видового диагноза по генотипам отмечено для 67% особей, причем предположительно «чистых» южных ежей оказалось в два раза больше, чем «чистых» европейских. Для 33% всех генотипированных ежей диагноз по мтДНК разошелся с диагнозом по яДНК. В подавляющем большинстве случае интрогрессированные особи несут митохондриальный гаплотип E. europaeus. Генотипирование обыкновенных ежей на территории Средней и южной России, а также Западной Сибири позволило составить представление об истинном распределении видов E. europaeus и E. roumanicus в восточной части их ареалов. 6. В отчетном периоде совместно с сотрудником Зоомузея МГУ В.С. Лебедевым и студентом 4-го курса кафедры зоологии позвоночных Снытниковым Е.А. начаты исследования по филогеографии Dipus sagitta – одного из наиболее широкоареальных видов тушканчиков, обладающего значительной морфологической изменчивостью (12-15 подвидов, объединяемые в две большие группы). Получены первые данные по последовательностям гена cytb для >100 особей, со всей территории Монголии, из Зайсанской котловины, Прибалхашья, Кызылкумов, и отдельных районов Китая. Предварительные результаты указывают на сложный характер географической изменчивости, лишь частично согласующийся с подвидовой структурой по морфологическим данным. Уровень дивергенции между некоторыми филогруппами потенциально соответствует видовому. Публикации Вышедшие из печати: 1. Bannikova A.A., Zemlemerova E.D., Colangelo P., Sözen M., Sevindik M., Kidov A.A. Dzuev R.I., Kryštufek B., Lebedev V.S. 2015. An underground burst of diversity – a new look at the phylogeny and taxonomy of the genus Talpa Linnaeus, 1758 (Mammalia: Talpidae) as revealed by nuclear and mitochondrial genes // Zoological Journal of the Linnean Society. doi: 10.1111/zoj.12298. 175:930-948. 2. Банникова А.А., Е.Д. Землемерова, В.С. Лебедев, Д.Ю. Александров, Ю. Фанг (Yun Fang), Б.И. Шефтель, 2015. Филогенетическое положение ганьсуйского крота Scapanulus oweni Thomas, 1912 (Mammalia, Talpidae) и взаимоотношения высокоспециализированных подземных групп кротовых // Доклады Академии Наук. Т. 464. № 2. С. 238–242 DOI: 10.7868/S0869565215260266 [Bannikova A.A., Zemlemerova E.D., Lebedev V.S., D.Yu. Aleksandrov, Yun Fang, Sheftel B.I. 2015. Phylogenetic Position of the Gansu Mole Scapanulus oweni Thomas,1912 and the Relationships Between Strictly Fossorial Tribes of the Family Talpidae// Doklady Biological Sciences, 2015, Vol. 464, pp. 230–234. © Pleiades Publishing, Ltd.] 3. Julie Pisano, Fabien L. Condamine, Vladimir Lebedev, Anna Bannikova, François Catzeflis, Jean-Pierre Quéré, Georgy I. Shenbrot, Marie Pagès, Johan R. Michaux, 2015. Out-of-Himalaya: Evolutionary history of the Dipodoidea (Rodentia) evidence the impact of Asian environmental changes // J.Biogeography. doi:10.1111/jbi.12476. IF 4.969 4. Feuda R, Bannikova AA, Zemlemerova ED, Di Febbraro M, Loy A, Hutterer R, Aloise G, Zykov AE, Annesi F. , Colangelo P. 2015. Tracing the evolutionary history of the mole, Talpa europaea, through mitochondrial DNA phylogeography and species distribution modeling // Biological Journal of the Linnean Society 114: 495-512. IF 2.535 5. Igea J., Aymerich P., Bannikova A.A., Gosálbez J., Castresana J. 2015. Multilocus species trees and species delimitation in a temporal context: application to the water shrews of the genus Neomys. BMC Evolutionary Biology 15: 209. DOI 10.1186/s12862-015-0485-z. 6. Хляп Л.А., Малыгин В.М., Банникова А.А., Богданов А.С., Артюшин И.В., Петросян В.Г. К изучению разнообразия млекопитающих (Mammalia) заповедника «Утриш» // Охрана биоты в государственном природном заповеднике «Утриш». Научные труды. Том 3. 2014. Майкоп: ООО «Полиграф-ЮГ». 2015 г. C. 311-320. ISBN 978-5-9906063-8-8 Публикации, подготовленные к печати: 7. И.В. Артюшин, С.В. Крускоп, В.С. Лебедев, А.А. Банникова. Молекулярная филогения кожанов (Mammalia, Chiroptera, Eptesicus) с акцентом на исторической эволюции и таксономии видовой группы “E. serotinus”// Известия РАН, подано в печать. 8. ELENA D. ZEMLEMEROVA, ANNA A. BANNIKOVA, VLADIMIR S. LEBEDEV, VIATCHESLAV V. ROZHNOV and ALEXEI V. ABRAMOV. Secrets of the underground Vietnam: an underestimated species diversity of Asian moles (Lipotyphla, Talpidae, Euroscaptor) // Zootaxa, submitted. Участие в конференциях 1. А.А. Банникова. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ СТРУКТУРЫ ВИДОВ И РАСПОЗНАВАНИЕ ВИДОВЫХ ГРАНИЦ // Материалы научной конференции «Структура вида у млекопитающих» 21-23 октября 2015 г. ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. Приглашенный доклад. 2. А. А. Распопова , А.А. Банникова , В.С. Лебедев. ПОСЛЕЛЕДНИКОВАЯ ЭКСПАНСИЯ ОБЫКНОВЕННОЙ БУРОЗУБКИ (SOREX ARANEUS L., 1758) // Материалы научной конференции «Структура вида у млекопитающих» 21-23 октября 2015 г. ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. Устное выступление. 3. Е.Д. Землемерова, А.А. Банникова, В.С. Лебедев, А.В. Абрамов, В.В. Рожнов. КРИПТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ КРОТОВ ВЬЕТНАМА (LIPOTYPHLA, TALPIDAE, EUROSCAPTOR) // Материалы научной конференции «Структура вида у млекопитающих» 21-23 октября 2015 г. ИПЭЭ им. А.Н. Северцова РАН. Стендовый доклад. Отечественные гранты Работа поддержана грантом РФФИ №14-04-00034_a (Р); РФФИ №15-29-02771_офи-м и РНФ 14-50-00029. Сотрудничество с зарубежными партнерами Boris Kryštufek – University of Primorska, Science and Research Centre of Koper, Garibaldijeva 1, SI-6000 Koper, Slovenia (Словения). Paolo Colangelo: Università di Roma “La Sapienza”, Dipartimento di Biologia Animale e dell'Uomo. (Италия) Jose Castresana: Institute of Evolutionary Biology (CSIC-UPF). Passeig Maritim de la Barceloneta 37 08003, Barcelona, Spain (Испания). Командировки Монголия и Казахстан: 20 июля-27 августа. Учебный процесс 1. Чтение курса «Молекулярно-генетические методы в систематике и экологии» и практикум по курсу «Молекулярно-генетические методы в систематике и экологии» для III курса каф. Зоологии позвоночных (2-й семестр III курса). 2. Чтение спецкурса по выбору «Основы биологической систематики и филогенетики» (2-й семестр III курса). 2. Летняя практика на ЗБС (июнь). 3. Руководство аспирантами: Землемерова Е.Д., заоч.асп. Матвеева К., соискатель Бурская В.О. Руководство бакалаврской работой студента 4-го курса Снытникова Е.А.