Самыгина Валерия Ролановна — профиль | ИСТИНА

vsamygina

Самыгина Валерия Ролановна vsamygina

кандидат физико-математических наук

ФГУ "ФНИЦ "Кристаллография и фотоника"РАН", лаборатория рентгеновских методов анализа и синхронного излучения, старший научный сотрудник

IstinaResearcherID (IRID): 103267537

ORCID: 0000-0002-1528-5972

ResearcherID: A-9069-2014

Статьи в журналах Тезисы докладов Доклады на научных конференциях НИР и НИОКР Оппонирование диссертаций Руководство дипломными работами Выступления в СМИ

–

Статьи в журналах

- 2024 The structure of inactivated mature tick-borne encephalitis virus at 3.0 Å resolution
- Pichkur Evgeny B., Vorovitch Mikhail F., Ivanova Alla L., Protopopova Elena V., Loktev Valery B., Osolodkin Dmitry I., Ishmukhametov Aydar A., Samygina Valeriya R.
- в журнале Emerging Microbes & Infections, издательство TAYLOR & FRANCIS LTD (4 PARK SQUARE, MILTON PARK, ABINGDON,ENGLAND, OXON, OX14 4RN), том 13, № 1 DOI
- 2024 Preparation and characterization of inactivated tick-borne encephalitis virus samples for single-particle imaging at the European XFEL
- Vorovitch Mikhail F., Samygina Valeriya R., Pichkur Evgeny, Konarev Peter V., Peters Georgy, Khvatov Evgeny V., Ivanova Alla L., Tuchynskaya Ksenia K., Konyushko Olga I., Fedotov Anton Y., Armeev Grigory, Shaytan Konstantin V., Kovalchuk Mikhail V., Osolodkin Dmitry I., Egorov Alexey M., Ishmukhametov Aydar A.
- в журнале ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY, том 80, № 1, с. 44-59 DOI
- 2023 S-nitrosylation and S-glutathionylation of GAPDH: Similarities, differences, and relationships
- Medvedeva M.V., Kleimenov S.Yu, Samygina V.R., Muronetz V.I., Schmalhausen E.V.
- в журнале Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1867, № 9, с. 1-12 DOI
- 2022 Variability in the Spatial Structure of the Central Loop in Cobra Cytotoxins Revealed by X-ray Analysis and Molecular Modeling
- Dubovskii Peter V., Dubova Kira M., Bourenkov Gleb, Starkov Vladislav G., Konshina Anastasia G., Efremov Roman G., Utkin Yuri N., Samygina Valeriya R.
- в журнале Toxins, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 14, № 2 DOI
- 2022 Local Flexibility of a New Single-Ring Chaperonin Encoded by Bacteriophage AR9 Bacillus subtilis
- Sokolova Olga S., Pichkur Evgeny B., Maslova Ekaterina S., Kurochkina Lidia P., Semenyuk Pavel I., Konarev Petr V., Samygina Valeriya R., Stanishneva-Konovalova Tatiana B.
- в журнале BIOMEDICINES, том 10, № 10, с. 2347 DOI
- 2022 Crystal structures of the molecular class A β-lactamase TEM-171 and its complexes with tazobactam
- Grigorenko Vitaly G., Petrova Tatiana E., Carolan Ciaran, Rubtsova Maya Yu, Uporov Igor V., Pereira Joana, Chojnowski Grzegorz, Samygina Valeriya R., Lamzin Victor S., Egorov Alexey M.
- в журнале ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY, том 78, № 7, с. 825-834 DOI
- 2021 Колонка главного редактора
- Ковальчук М.В., Попов В.О., Самыгина В.Р.
- в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 66, № 5, с. 675-676 DOI
- 2021 ПРЕДВАРИТЕЛЬНЫЕ СТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ИНАКТИВИРОВАННОГО ВИРУСА ЖЕЛТОЙ ЛИХОРАДКИ
- ПИЧКУР Е.Б., САМЫГИНА В.Р.*, ИВАНОВА А.Л., ФЕДОТОВ А.Ю., ИВАНОВ А.П., ХВАТОВ Е.В., ИШМУХАМЕТОВ А.А., ВОРОВИЧ М.Ф.
- в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 65, № 6, с. 914-920
- 2021 Кристаллизация в условиях микрогравитации и структура атомного разрешения уридинфосфорилазы из vibrio cholerae
- Эйстрих-Геллер П.А., Рубинский С.В., Самыгина В.Р., Габдулхаков А.Г., Ковальчук М.В., Миронов А.С., Лашков А.А.
- в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 66, № 5, с. 750-758
- 2018 Small-Angle X-ray Scattering Study of Macrophage Migration Inhibitory Factor Complexed with Albumin
- Petoukhov M.V., Sokolov A.V., Dadinova L.A., Gorbunov N.P., Svergun D.I., Samygina V.R.
- в журнале Crystallography Reports, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 63, № 4, с. 589-593 DOI
- 2018 Structural Study of the Complex Formed by Ceruloplasmin and Macrophage Migration Inhibitory Factor
- Sokolov A.V., Dadinova L.A., Petoukhov M.V., Bourenkov G., Dubova K.M., Amarantov S.V., Volkov V.V., Kostevich V.A., Gorbunov N.P., Grudinina N.A., Vasilyev V.B., Samygina V.R.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № 6, с. 701-707 DOI
- 2017 Rat ceruloplasmin: a new labile copper binding site and zinc/copper mosaic
- Samygina V.R., Sokolov A.V., Bourenkov G., Schneider T.R., Anashkin V.A., Kozlov S.O., Kolmakov N.N., Vasilyev V.B.
- в журнале Metallomics : integrated biometal science, издательство RSC Publishing (Cambridge, England), том 9, № 12, с. 1828-1838 DOI
- 2017 Structural studies of macrophage migration inhibitory factor interaction with ceruloplasmin
- Samygina V., Sokolov A., Dadinova L., Amarantov S., Kordonskaya Y., Dubova K., Petoukchov M., Bourenkov G., Kostevich V., Gorbunov N., Vassilyev V.
- в журнале FEBS Journal, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 284, с. 202-202 DOI
- 2016 Inorganic pyrophosphatases: structural diversity serving the function
- Samygina V.R.
- в журнале Russian Chemical Reviews, издательство Turpion - Moscow Ltd. (United Kingdom), том 85, № 5, с. 464-476 DOI
- 2016 Protein crystallization under microgravity conditions. Analysis of the results of Russian experiments performed n the International Space Station in 2005−2015
- Boyko K.M., Timofeev V.I., Samygina V.R., Kuranova I.P., Popov V.O., Kovalchuk M.V.
- в журнале Crystallography Reports, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 61, № 5, с. 718-729 DOI
- 2016 Кристаллизация белков в условиях микрогравитации. Анализ результатов российских экспериментов на МКС в 2005–2015 гг
- Бойко К.М., Тимофеев В.И., Самыгина В.Р., Куранова И.П., Попов В.О., Ковальчук М.В.
- в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 61, № 5, с. 691-702 DOI
- 2015 Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the family 54 carbohydrate-binding module from laminarinase ($\upbeta$-1,3-glucanase) Lic16A ofClostridium thermocellum
- Kislitsyn Yury A., Samygina Valeriya R., Dvortsov Igor A., Lunina Nataliya A., Kuranova Inna P., Velikodvorskaya Galina A.
- в журнале Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, издательство International Union of Crystallography (United Kingdom), том 71, № 2, с. 217-220
- 2015 Interaction of ceruloplasmin with eosinophil peroxidase as compared to its interplay with myeloperoxidase: Reciprocal effect on enzymatic properties
- Sokolov A.V., Kostevich V.A., Zakharova E.T., Samygina V.R., Panasenko O.M., Vasilyev V.B.
- в журнале Free Radical Research, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 49, № 6, с. 800-811 DOI
- 2015 Sphingolipid transfer proteins defined by the GLTP-fold
- Malinina Lucy, Simanshu Dhirendra K., Zhai Xiuhong, Samygina Valeria R., Kamlekar RaviKanth, Kenoth Roopa, Ochoa-Lizarralde Borja, Malakhova Margarita L., Molotkovsky Julian G., Patel Dinshaw J., Brown Rhoderick E.
- в журнале Quarterly Reviews of Biophysics, издательство Cambridge University Press (United Kingdom), том 48, № 03, с. 281-322 DOI
- 2015 Interaction of macrophage migration inhibitory factor with ceruloplasmin: role of labile copper ions
- Kostevich Valeria A., Sokolov Alexey V., Grudinina Natalia A., Zakharova Elena T., Samygina Valeria R., Vasilyev Vadim B.
- в журнале BioMetals, издательство Springer Nature (Switzerland), том 28, № 5, с. 817-826
- 2014 Lactoferrin, myeloperoxidase, and ceruloplasmin: complementary gearwheels cranking physiological and pathological processes
- Sokolov Alexey V., Zakahrova Elena T., Kostevich Valeria A., Samygina Valeria R., Vasilyev Vadim B.
- в журнале BioMetals, издательство Springer Nature (Switzerland), том 27, № 5, с. 815-828
- 2013 Structural insights into lipid-dependent reversible dimerization of human GLTP
- Samygina Valeria R., Ochoa-Lizarralde Borja, Popov Alexander N., Cabo-Bilbao Aintzane, Goni-de-Cerio Felipe, Molotkovsky Julian G., Patel Dinshaw J., Brown Rhoderick E., Malinina Lucy
- в журнале Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 69, № 4, с. 603-616 DOI
- 2013 Ceruloplasmin: Macromolecular Assemblies with Iron-Containing Acute Phase Proteins
- Samygina Valeriya R., Sokolov Alexey V., Bourenkov Gleb, Petoukhov Maxim V., Pulina Maria O., Zakharova Elena T., Vasilyev Vadim B., Bartunik Hans, Svergun Dmitri I.
- в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 8, № 7, с. e67145 DOI
- 2011 Enhanced Selectivity for Sulfatide by Engineered Human Glycolipid Transfer Protein
- Samygina Valeria R., Popov Alexander N., Cabo-Bilbao Aintzane, Ochoa-Lizarralde Borja, Goni-de-Cerio Felipe, Zhai Xiuhong, Molotkovsky Julian G., Patel Dinshaw J., Brown Rhoderick E., Malinina Lucy
- в журнале Structure, издательство Cell Press (United States), том 19, № 11, с. 1644-1654
- 2010 X-ray investigation of gene-engineered human insulin crystallized from a solution containing polysialic acid
- Timofeev V.I., Chuprov-Netochin R.N., Samigina V.R., Bezuglov V.V., Miroshnikov K.A., Kuranova I.P.
- в журнале Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, издательство International Union of Crystallography (United Kingdom), том 66, № 3, с. 259-263
- 2010 Recombinant formate dehydrogenase from Arabidopsis thaliana: Preparation, crystal growth in microgravity, and preliminary X-ray diffraction study
- Shabalin I.G., Serov A.E., Skirgello O.E., Timofeev V.I., Samygina V.R., Popov V.O., Tishkov V.I., Kuranova I.P.
- в журнале Crystallography Reports, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 55, № 5, с. 806-810 DOI
- 2009 Structural and kinetic features of family I inorganic pyrophosphatase from Vibrio cholerae
- Rodina E.V., Samygina V.R., Vorobyeva N.N., Sitnik T.S., Kurilova S.A., Nazarova T.I.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 74, № 7, с. 734-742 DOI
- 2008 Рентгеноструктурный анализ высокоочищенного церулоплазмина человека
- Самыгина В.Р., Соколов А.В., Пулина М.О., Бартуник Г., Васильев В.Б.
- в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 53, № 4, с. 690-698
- 2008 Ceruloplasmin and myeloperoxidase in complex affect the enzymatic properties of each other
- Sokolov Alexej V., Ageeva Kira V., Pulina Maria O., Cherkalina Olga S., Samygina Valeria R., Vlasova Irina I., Panasenko Oleg M., Zakharova Elena T., Vasilyev Vadim B.
- в журнале Free Radical Research, издательство Taylor & Francis (United Kingdom), том 42, № 11-12, с. 989-998
- 2007 Reversible inhibition of Escherichia coli inorganic pyrophosphatase by fluoride: trapped catalytic intermediates in cryo-crystallographic studies
- Samygina V.R., Moiseev V.M., Rodina E.V., Vorobyeva N.N., Popov A.N., Kurilova S.A., Nazarova T.I., Avaeva S.M., Bartunik H.D.
- в журнале Journal of Molecular Biology, издательство Academic Press (United States), том 366, № 4, с. 1305-1317 DOI
- 2001 The structures of Escherichia coli inorganic pyrophosphatase complexed with Ca(2+) or CaPP(i) at atomic resolution and their mechanistic implications
- Samygina V.R., Popov A.N., Rodina E.V., Vorobyeva N.N., Lamzin V.S., Polyakov K.M., Kurilova S.A., Nazarova T.I., Avaeva S.M.
- в журнале Journal of Molecular Biology, издательство Academic Press (United States), том 314, № 3, с. 633-645 DOI
- 2000 Improving the X-ray resolution by reversible flash-cooling combined with concentration screening, as exemplified with PPase
- Samygina Valeriya R., Antonyuk Svetlana V., Lamzin Victor S., Popov Alexander N.
- в журнале Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom), том 56, № 5, с. 595-603
- 2000 Механизм ингибирования неорганической пирофосфатазы Escherichia coli ионами кальция
- Аваева С.М., Воробьева Н.Н., Курилова С.А., Назарова Т.И., Поляков К.М., Родина Е.В., Самыгина В.Р.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 65, с. 442-458
- 2000 Mechanism of Ca2+-induced inhibition of Escherichia coli inorganic pyrophosphatase
- Avaeva S.M., Vorobyeva N.N., Kurilova S.A., Nazarova T.I., Polyakov K.M., Rodina E.V., Samygina V.R.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 65, № 3, с. 373-387
- 1998 Структуры мутантных неорганических пирофосфатаз E. coli с заменами остатков аспарагиновых кислот 42, 65, 70 и 97 на аспарагин
- Аваева С.М., Родина Е.В., Воробьева Н.Н., Курилова С.А., Назарова Т.И., Склянкина В.А., Оганесян В.Ю., Самыгина В.Р., Арутюнян Э.Г.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 63, с. 797-811
- 1998 Three-dimensional structures of mutant forms of E. coli inorganic pyrophosphatase with Asp–>Asn single substitution in positions 42, 65, 70, and 97
- Avaeva S.M., Rodina E.V., Vorobyeva N.N., Kurilova S.A., Nazarova T.I., Sklyankina V.A., Oganessyan V.Y., Samygina V.R., Harutyunyan E.H.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 63, № 6, с. 671-684
- 1995 FERROELECTRIC PROPERTIES OF LNBSIO(5) (LN=LA, PR) BOROSILICATES, STRUCTURAL ANALOGS OF STILLWELLITE
- STEFANOVICH SY, SIGAEV VN, DECHEV AV, MOSUNOV AV, SAMYGINA VR, LEONYUK NI, SARKISOV PD
- в журнале Inorganic Materials, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 31, № 6, с. 756-759
- 1993 Crystal structure of synthetic stillwelite
- Samygina V.R., Genkina E.A., Maksimov B.A., Leonyuk N.I.
- в журнале Crystallography Reports, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 38, № 6, с. 741-743
- 1993 Synthesis and crystal structure of La-stillwellite
- Samygina V.R., Genkina E.A., Maksimov B.A., Leonyuk N.I.
- в журнале Crystallography Reports, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 38, № 6, с. 744-746
- 1993 Синтез и кристаллическая структура La-стилвеллита
- Самыгина В.Р., Генкина Е.А., Максимов Б.А., Леонюк Н.И.
- в журнале Кристаллография, издательство ФГУП Издательство «Наука» (Москва), том 38, № 6, с. 61-65

Тезисы докладов

- 2017 Структурные исследования взаимодействия фактора ингибирования миграции макрофагов с альбумином
- Самыгина В.Р., Петухов М.В., Соколов А.В., Дадинова Л.А., Костевич В.А., Кислицын Ю.А., Васильев В.Б., Свергун Д.И.
- в сборнике НАУЧНЫЕ ТРУДЫ ОБЪЕДИНЁННЫЙ НАУЧНЫЙ ФОРУМ МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ ПО БИООРГАНИЧЕСКОЙ ХИМИИ «XII ЧТЕНИЯ ПАМЯТИ АКАДЕМИКА ЮРИЯ АНАТОЛЬЕВИЧА ОВЧИННИКОВА» VIII РОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ «БЕЛКИ И ПЕПТИДЫ», серия Acta Naturae, Спецвыпуск 2017, место издания Парк-медиа Москва, том 9, тезисы, с. 109-109
- 2015 Взаимодействие церулоплазмина с фактором ингибирования миграции макрофагов: структурные и биохимические исследования
- Самыгина В.Р., Соколов А.В., Костевич В.А., Дадинова Л.А., Петухов М., Захарова Е.Т., Свергун Д.И., Васильев В.Б., Буренков Г., Schneider Т.R.
- в сборнике V Съезд биофизиков России, Южный Федеральный университет, Ростов-на-Дону, 4-10 октября 2015 года, Материалы докладов, место издания Издательство Южного Федерального университета Ростов-на-Дону, том 2, тезисы, с. 276

Доклады на научных конференциях

- 2022 ОПРЕДЕЛЕНИЕ СТРУКТУРЫ TEM-171 β-ЛАКТАМАЗЫ И ЕЕ КОМПЛЕКСОВ С ИНГИБИТОРАМИ (Устный)
- Авторы: Петрова Т.Е., Григоренко В.Г., Carolan C., Рубцова М.Ю., Упоров И.В., Pereira J., Chojnowski G., Самыгина В.Р., Ламзин В.С., Егоров А.М.
- Всероссийская конференция «Теоретические основы конструирования численных алгоритмов и решение задач математической физики», посвященная памяти К. И. Бабенко, Пущино, Московская область, Russia, 24-26 августа 2022
- 2017 Structural studies of macrophage migration inhibitory factor interaction with ceruloplasmin (Стендовый)
- Авторы: Samygina V., Sokolov A., Dadinova L., Amarantov S., Kordonskaya Y., Dubova K., Petoukchov M., Bourenkov G., Kostevich V., Gorbunov N., Vassilyev V.
- 42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back", Иерусалим, Israel, 10-14 сентября 2017
- 2009 Возможные механизмы осмоадаптации неорганической пирофосфатазы из Vibrio сholerae (Устный)
- Авторы: Родина Е.В., Самыгина В.Р., Курилова С.А., Воробьева Н.Н., Назарова Т.И.
- IV Российский симпозиум «Белки и пептиды», Казань, 2009

НИР и НИОКР

- 16 февраля 2023 - 16 февраля 2026 Исследование пространственной организации нативных и патологических макромолекулярных образований методами криоэлектронной микроскопии на in vivo- и in vitro-моделях.
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Голышев С.А. Ответственные исполнители: Овсянникова Н.Л., Курочкина Л.П. Участники НИР: Кудрявцева С.С., Лейси Е.В., Поздышев Д.В., Самыгина В.Р., Осипова В.Р., Цыганов К.О., Лаврушкина С.В., Казаков Е.П.
- 1 января 2011 - 31 декабря 2011 Молекулярные механизмы регуляции фосфогидролаз DHH-семейства
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Байков А.А. Участники НИР: Самыгина В.Р., Магретова Н.Н., Евтушенко О.А.
- 1 января 2010 - 31 декабря 2010 Молекулярные механизмы регуляции фосфогидролаз DHH-семейства
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Байков А.А. Участники НИР: Самыгина В.Р., Магретова Н.Н., Евтушенко О.А.

Оппонирование диссертаций

- 2018 Структурно-функциональные исследования РНК-связывающих свойств белков семейства Lsm из архей
- Кандидатская диссертация по специальности 03.01.03 - Молекулярная биология (биол. науки)
- Автор: Леконцева Наталья Владимировна
- Научный руководитель: Никулин Алексей Донатович, д.х.н.
- Защищена в совете МГУ.015.4 МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
- Организация, в которой выполнялась работа: ФГБУН Институт белка РАН
- Оппоненты: Самыгина Валерия Ролановна, Сергиев Петр Владимирович, Кульбачинский Андрей Владимирович

Руководство дипломными работами

- 2016 Кристаллизация фактора ингибирующего миграцию макрофагов различными методами
- Научные руководители: Стремоухов С.Ю., Самыгина Валерия Ролановна
- Автор: Кордонская Юлия Владимировна (Бакалавр)
- 2011 Структурное исследование комплексов неорганической пирофосфатазы из M.tuberculosis с активаторами и ингибиторами
- Научные руководители: Самыгина В.Р., Родина Е.В.
- Автор: Лунев Сергей Владимирович (Специалист)
- 2007 Особенности функционирования неорганической пирофосфатазы M.tuberculosis
- Научные руководители: Родина Е.В., Самыгина В.Р.
- Автор: Вайнонен Людмила Павловна (Специалист)

Выступления в СМИ

- 25 ноября 2019 г. Ученые увидели в деталях молекулу вируса клещевого энцефалита Информация взята с портала «Научная Россия» (https://scientificrussia.ru/) («Научная Россия» - электронное периодическое издание)
- Автор (участник): Самыгина Валерия Ролановна