Статьи в журналах
Тезисы докладов
Доклады на научных конференциях
НИР и НИОКР
Награды и премии
Диссертации
Руководство курсовыми работами
Преподавание учебных курсов
Выступления в СМИ
–
Статьи в журналах
-
- 2023 Relocalization of Translation Termination and Ribosome Recycling Factors to Stress Granules Coincides with Elevated Stop-Codon Readthrough and Reinitiation Rates upon Oxidative Stress
- Makeeva Desislava S., Riggs Claire L., Burakov Anton V., Ivanov Pavel A., Kushchenko Artem S., Bykov Dmitri A., Popenko Vladimir I., Prassolov Vladimir S., Ivanov Pavel V., Dmitriev Sergey E.
- в журнале Cells, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 12, № 2, с. 259 DOI
-
- 2021 Ribo-Seq and RNA-Seq of TMA46 (DFRP1) and GIR2 (DFRP2) knockout yeast strains
- Egorov Artyom A., Makeeva Desislava S., Makarova Nadezhda E., Bykov Dmitri A., Hrytseniuk Yanislav S., Mitkevich Olga V., Urakov Valery N., Alexandrov Alexander I., Kulakovskiy Ivan V., Dmitriev Sergey E.
- в журнале F1000Research, том 10, с. 1162 DOI
-
- 2021 A standard knockout procedure alters expression of adjacent loci at the translational level
- Egorov Artyom A., Alexandrov Alexander I., Urakov Valery N., Makeeva Desislava S., Edakin Roman O., Kushchenko Artem S., Gladyshev Vadim N., Kulakovskiy Ivan V., Dmitriev Sergey E.
- в журнале Nucleic Acids Research, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 49, № 19, с. 11134-11144 DOI
-
- 2019 Translatome and transcriptome analysis of TMA20 (MCT-1) and TMA64 (eIF2D) knockout yeast strains
- Makeeva Desislava S., Lando Andrey S., Anisimova Aleksandra, Egorov Artyom A., Logacheva Maria D., Penin Alexey A., Andreev Dmitry E., Sinitcyn Pavel G., Terenin Ilya M., Shatsky Ivan N., Kulakovskiy Ivan V., Dmitriev Sergey E.
- в журнале Data in Brief, издательство Elsevier Inc. (США), том 23, с. 103701 DOI
-
- 2019 A novel uORF-based regulatory mechanism controls translation of the human MDM2 and eIF2D mRNAs during stress
- Akulich Kseniya A., Sinitcyn Pavel G., Makeeva Desislava S., Andreev Dmitry E., Terenin Ilya M., Anisimova Aleksandra S., Shatsky Ivan N., Dmitriev Sergey E.
- в журнале Biochimie, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 157, с. 92-101 DOI
-
- 2018 Tma64/eIF2D, Tma20/MCT-1, and Tma22/DENR Recycle Post-termination 40S Subunits In Vivo
- Young David J., Makeeva Desislava S., Zhang Fan, Anisimova Aleksandra S., Stolboushkina Elena A., Ghobakhlou Fardin, Shatsky Ivan N., Dmitriev Sergey E., Hinnebusch Alan G., Guydosh Nicholas R.
- в журнале Molecular Cell, издательство Cell Press (United States), том 71, № 5, с. 761-774.e5 DOI
-
- 2017 Expression of Cholesterol Hydroxylase/Lyase System Proteins in Yeast S. cerevisiae Cells as a Self-Processing Polyprotein
- Efimova Vera S., Isaeva Ludmila V., Makeeva Desislava S., Rubtsov Mikhail A., Novikova Ludmila A.
- в журнале Molecular Biotechnology, издательство Springer International Publishing AG (Cham, Switzerland), том 59, № 9-10, с. 394-406 DOI
-
- 2016 Four translation initiation pathways employed by the leaderless mRNA in eukaryotes
- Akulich Kseniya A., Andreev Dmitry E., Terenin Ilya M., Smirnova Victoria V., Anisimova Aleksandra S., Makeeva Desislava S., Arkhipova Valentina I., Stolboushkina Elena A., Garber Maria B., Prokofjeva Maria M., Spirin Pavel V., Prassolov Vladimir S., Shatsky Ivan N., Dmitriev Sergey E.
- в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 6, с. 37905 DOI
-
- 2016 Amicoumacin A induces cancer cell death by targeting the eukaryotic ribosome
- Prokhorova Irina V., Akulich Kseniya A., Makeeva Desislava S., Osterman Ilya A., Skvortsov Dmitry A., Sergiev Petr V., Dontsova Olga A., Yusupova Gulnara, Yusupov Marat M., Dmitriev Sergey E.
- в журнале Scientific reports, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 6, с. 27720 DOI
-
- 2014 Comparison of the results of PCR analysis of gene expression in breast cancer tissue specimens stabilized in formalin and RNAlater
- Khaustova N.A., Makeeva D.S., Kondrashina O.V., Fedotov N.N., Nechaev I.N., Savelov N.A., Grinevich V.N., Maltseva D.V., Galatenko V.V., Shkurnikov M.Y.
- в журнале Bulletin of Experimental Biology and Medicine, издательство Springer Nature (Switzerland), том 156, № 4, с. 486-490 DOI
-
- 2013 Оценка потенциальных референсных генов для нормализации данных ПЦР-РВ в экспериментах с клетками линии HeLa
- Крайнова Н.А., Хаустова Н.А., Макеева Д.C., Федотов Н.Н., Гудим Е.А., Рябенко Е.А., Шкурников М.Ю., Галатенко В.В., Сахаров Д.А., Мальцева Д.В.
- в журнале Биотехнология, издательство ГосНИИгенетика (М.), № 1, с. 42-50
-
Тезисы докладов
-
- 2017 Real-time luciferase measurement in living cells and its application for investigation of protein biosynthesis
- Akulich K., Anisimova A., Terenin I., Andreev D., Smirnova V., Bykov D., Makeeva D., Shatsky I., Dmitriev S.
- в сборнике FEBS Journal, серия Supplement: 42nd FEBS Congress, From Molecules to Cells and Back, место издания Blackwell Publishing Inc United Kingdom, том 284, тезисы, с. 102-403 DOI
-
- 2015 Expression of bovine cytochrome P450scc enzyme system in Saccharomyces cerevisiae cells as a self-processing polyprotein
- Efimova V.S., Isaeva L.V., Makeeva D.S., Rubtsov M.A., Novikova L.A.
- в сборнике FEBS Journal (Suppl. 1), место издания Berlin, том 282, тезисы, с. 92
-
- 2015 "Реконструкция ферментативной системы цитохрома P450scc в дрожжах S. cerevisiae"
- Ефимова В.С., Исаева Л.В., Макеева Д.С., Новикова Л.А., Рубцов М.А.
- в сборнике Материалы Международного молодежного научного форума «Ломоносов-2015», издательство ООО "МАКС Пресс" (Москва), тезисы, с. 255 -255
- редакторы Андреев А.И., Андриянов Андрей Владимирович, Антипов Евгений Александрович
-
- 2012 Коэкспрессия белков холестерингидроксилазной/лиазной системы быка в клетках Escherichia coli. VIII
- Макеева Д.С., Довбня Д., Донова М.В., Новикова Л.А.
- в сборнике Сборник тезисов VIII молодежной школы-конференции с международным участием АКТУАЛЬНЫЕ АСПЕКТЫ СОВРЕМЕННОЙ МИКРОБИОЛОГИИ, место издания Макс Пресс Москва, тезисы, с. 22-24
Доклады на научных конференциях
-
- 2022 Клеточный ответ на окислительный стресс приводит к изменению активности и локализации факторов терминации трансляции и рециклинга рибосом (Приглашенный)
- Авторы: Макеева Д.С., Бураков А.В., Риггс К.Л., Иванов П.А., Кущенко А.С., Быков Д.А., Прасолов В.С., Иванов П.В., Дмитриев С.Е.
- III Объединенный Научный Форум Физиологов, Биохимиков И Молекулярных Биологов, Сочи, Russia, 3-7 октября 2022
-
- 2021 Анализ данных рибосомного профайлинга выявил проблему общеупотребимой коллекции нокаутных штаммов дрожжей (Устный)
- Авторы: Дмитриев С.Е., Егоров А.А., Макеева Д.С., Кулаковский И.В., Едакин Р.О., Макарова Н.Е., Кущенко А.С., Волынкина И.А.
- Отчётная конференция по гранту РФФИ_Наставник, НТУ "Сириус", Сочи, Russia, 29 апреля 2021
-
- 2020 Interaction of mRNA binding proteins with the human ribosome revealed by eCLIP data analysis (Стендовый)
- Авторы: Buyan Andrey I., Makeeva Desislava S., Egorov Artyom A., Gladyshev Vadim N., Kulakovskiy Ivan V., Dmitriev Sergey E.
- Translational Control 2020, Cold Spring Harbor Laboratory, United States, 1-4 сентября 2020
-
- 2020 A standard knockout procedure affects expression of neighboring genes through translational mechanism (Стендовый)
- Авторы: Egorov Artyom A., Alexandrov Alexander I., Urakov Valeriy N., Kushenko Artyom S., Edakin Roman O., Makeeva Desislava S., Gladyshev Vadim N., Kulakovskiy Ivan V., Dmitriev Sergey E.
- Translational Control 2020, Cold Spring Harbor Laboratory, United States, 1-4 сентября 2020
-
- 2020 The role of MCTS1 and DENR proteins in acute leukemia and lymphoma (Стендовый)
- Авторы: Spirin Pavel, Hryhoruk Olena, Vagapova Elmira, Lebedev Timofey, Volinkina Inna, Makeeva Desislava, Buzdin Anton, Dmitriev Sergey, Prassolov Vladimir
- EHA25 Virtual Congress, Франкфурт, Germany, 11-14 июня 2020
-
- 2020 Molecular mechanisms of neighboring gene effect in the yeast knockout library (Стендовый)
- Авторы: Egorov A.A., Alexandrov A.I., Urakov V.N., Edakin R.O., Makeeva D.S., Gladyshev V.N., Kulakovskiy I.V., Dmitriev S.E.
- 3-rd International Conference "Homo sapiens liberatus", НИИ ФХБ Белозерского, Факультет Фундаментальной медицины МГУ имени Ломоносова, Russia, 20-21 февраля 2020
-
- 2019 Изучение особенностей вовлечения мРНК в стресс-гранулы при остановке биосинтеза белка в клетках млекопитающих (Стендовый)
- Авторы: Быков Дмитрий А., Бураков Антон В., Макарова Надежда Е., Акулич Ксения А., Макеева Десислава С., Попенко Владимир И., Спирин Павел В., Прасолов Владимир С., Дмитриев Сергей Е.
- II Объединенный научный форум, включающий VI Cъезд физиологов СНГ, VI Съезд биохимиков России и IX Российский симпозиум «Белки и пептиды», Дагомыс, Russia, 1-6 октября 2019
-
- 2019 Sequestration of termination and recycling factors to stress granules contributes to elevated stop-codon readthrough and translation reinitiation rates upon stress (Стендовый)
- Авторы: Makeeva D.S., Burakov A.V., Ivanov P.A., Kushchenko A.S., Bykov D.S., Prassolov V.S., Ivanov P.V., Dmitriev S.E.
- EMBO Workshop "Protein synthesis and translational control", Heidelberg, Germany, 4-7 сентября 2019
-
- 2019 The standard KanMX gene knockout cassette strongly affects the expression of neighboring genes at transcriptional and translational levels (Стендовый)
- Авторы: Egorov Artyom A., Edakin Roman O., Alexandrov Alexander I., Makeeva Desislava S., Kulakovskiy Ivan V., Dmitriev Sergey E., Gladyshev Vadim N.
- XXIX International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology (ICYGMB 2019), Gothenburg, Sweden, 18-22 августа 2019
-
- 2019 Structural and functional insights into eukaryotic translation reinitiation and ribosome recycling orchestrated by eIF2D and MCT-1/DENR (Стендовый)
- Авторы: Makeeva Desislava S., Stolboushkina Elena A., Lomakin Ivan B., Dmitriev Sergey E.
- Russian International Conference on Cryo-Electron Microscopy 2019 (RICCEM-2019, Moscow, June 02-05), Moscow, Russia, 2-5 июня 2019
-
- 2017 Translation factors TMA20/MCTS1, TMA22/DENR and TMA64/eIF2D clear mRNA stop codon from a post-termination complex, to counteract illegitimate reinitiation (Стендовый)
- Авторы: Makeeva D.S., Anisimova A.S., Stolboushkina E.A., Shatsky I.N., Dmitriev S.E.
- 12th International Scientific Conference on Bioorganic Chemistry devoted to the Memory of Professor Ovchinnikov/Международная научная конференция "XII чтения памяти академика Юрия Анатольевича Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды", Москва, Russia, 18-22 сентября 2017
-
- 2017 Real-time luciferase measurement in living cells and its application for investigation of protein biosynthesis (Стендовый)
- Авторы: Akulich Kseniya A., Anisimova Aleksandra S., Terenin Ilya M., Andreev Dmitry E., Smirnova Victoria V., Bykov Dmitry A., Makeeva Desislava S., Shatsky Ivan N., Dmitriev Sergey E.
- 42nd FEBS Congress "From molecules to cells and back", Иерусалим, Israel, 10-14 сентября 2017
-
- 2017 Real-time monitoring of luciferase activity in mRNA transfected cells: a powerful tool for studying protein biosynthesis (Стендовый)
- Авторы: Akulich K.A., Anisimova A.S., Terenin I.M., Andreev D.E., Smirnova V.V., Bykov D.A., Sergeeva O.V., Makeeva D.S., Zatsepin T.S., Abakumova T.O., Prikazchikova T.E., Shatsky I.N., Dmitriev S.E.
- EMBO Conference: Protein Synthesis and Translational Control, Heidelberg, Germany, 6-9 сентября 2017
-
- 2017 The yeast orthologs of eIF2D, MCT-1 and DENR function in recycling of 40S subunits at stop codons in vivo (Устный)
- Авторы: Young D., Makeeva D.S., Zhang F., Anisimova A.S., Stolboushkina E.A., Shatsky I.N., Hinnebusch A., Dmitriev S.E., Guydosh N.R.
- Gordon Research Conference “Translation Machinery in Health & Disease. Decoding Translation for Homeostasis”, Galveston, TX, United States, 19-24 марта 2017
-
- 2016 Four translation initiation pathways employed by the leaderless mRNA in eukaryotes (Устный)
- Авторы: Akulich K.A., Andreev D.E., Terenin I.M., Smirnova V.V., Anisimova A.S., Makeeva D.S., Arkhipova V.I., Stolboushkina E.A., Garber M.B., Prokofjeva M.M., Spirin P.V., Prassolov V.S., Shatsky I.N., Dmitriev S.E.
- Translational Control, Cold Spring Harbor, United States, 6-10 сентября 2016
-
- 2016 The role of the TMA64 (eIF2D) and TMA20 (MCTS1) proteins in translation reinitiation on uORF containing mRNAs (Стендовый)
- Авторы: Makeeva D.S., Stolboushkina E.A., Dmitriev S.E., Anisimova A.S.
- International Symposium at the Collaborative Research Center 944 “Physiology & Dynamics of Cellular Microcompartments” of University of Osnabrück, Collaborative Research Center 944 “Physiology & Dynamics of Cellular Microcompartments” of University of Osnabrück, Germany, 14-15 июля 2016
-
- 2014 Relocalization of translation factor eIF2D to the centrosome in mammalian cells upon stress (Стендовый)
- Авторы: Makeeva D.S., Sinitsyn P.G., Ivanov P.A., Andreev D.E., Terenin I.M., Dmitriev S.E.
- FEBS EMBO 2014 Conference, Paris, France, France, 30 августа - 4 сентября 2014
-
- 2014 eIF2D и его гомологи - неканонические факторы инициации трансляции эукариот (Приглашенный)
- Авторы: Макеева Десислава Станимировна, Синицын Павел Геннадьевич, Калмыкова Алла Ивановна, Дмитриев Сергей Евгеньевич
- XXI Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых ученых Ломоносов, Факультет психологии МГУ им. М.В. Ломоносова, 2014
НИР и НИОКР
-
- 27 ноября 2019 - 28 октября 2021 Последствия нарушения работы медицински значимых генов, связанных с биосинтезом белка: анализ на дрожжевых моделях
- Отдел взаимодействия вирусов с клеткой
- Руководитель: Дмитриев С.Е. Ответственный исполнитель: Макеева Д.С. Участники НИР: Кулаковский И.В., Егоров А.А., Кущенко А.С., Едакин Р.О., Волынкина И.А., Макарова Н.Е.
-
- 28 марта 2018 - 15 декабря 2022 Пространственная и временная регуляция биосинтеза белка в клетках млекопитающих
- Отдел взаимодействия вирусов с клеткой
- Руководитель: Дмитриев С.Е. Ответственные исполнители: Быков Д., Егоров А.А., Кущенко А.С., Лашкевич К.А., Макеева Д.С. Участники НИР: Анисимова А., Бавыкин А.С., Буян А.И., Быков Д., Владимиров Д.О., Егоров А.А., Едакин Р.О., Кедров А.В., Колюпанова Н.М., Конопатов А.В., Коноплева М.В., Кущенко А.С., Макарова Н.Е., Марина В.И., Меерсон М.Б., Тышковский А.Э.
-
- 1 января 2017 - 31 декабря 2019 Белковый синтез в старении и контроле продолжительности жизни
- Научно-исследовательский институт физико-химической биологии имени А.Н.Белозерского
- Руководитель: Гладышев В.Н. Ответственный исполнитель: Дмитриев С.Е. Участники НИР: Егоров А.А., Едакин Р.О., Шафиков Р.Р., Макеева Д.С., Марина В.И., Шубин С.Н., Быков Д., Кущенко А.С., Шубин С.Н., Меерсон М.Б., Донцова О.А., Волынкина И.А., Меерсон М.Б., Шубин С.Н., Макарова Н.Е., Кармушаков А.Ф., Александров А.И., Кинзина Э.Д., Лашкевич К.А., Гусев Ф.О., Тышковский А.Э., Анисимова А., Дементьева М.А., Буян А.И., Сергиев П.В., Тихонов С.А., Остерман И.А., Кулаковский И.В., Шиндяпина А.В., Савельев Н.В.
-
- 1 января 2016 - 31 декабря 2018 Новые механизмы регуляции трансляции индивидуальных мРНК и их роль в физиологии эукариотической клетки
- Отдел химии и биохимии нуклеопротеидов
- Руководитель: Дмитриев С.Е. Участники НИР: Анисимова А., Быков Д., Теренин И.М., Смирнова В.В., Лашкевич К.А., Макеева Д.С., Марина В.И.
-
- 20 мая 2014 - 31 декабря 2016 Идентификация генов раннего ответа клеток млекопитающих на внешние воздействия и изучение механизмов регуляции их экспрессии.
- Отдел химии и биохимии нуклеопротеидов
- Руководитель: Андреев Д.Е. Участники НИР: Анисимова А., Бикметов Д.В., Дмитриев С.Е., Лашкевич К.А., Макеева Д.С., Полянская С.А., Смирнова В.В., Теренин И.М., Шатский И.Н.
-
- 28 марта 2013 - 31 декабря 2015 Белковые факторы, участвующие в выборе стартового кодона при инициации трансляции у эукариот в норме и при клеточном стрессе
- Отдел химии и биохимии нуклеопротеидов
- Руководитель: Дмитриев С.Е. Участники НИР: Андреев Д.Е., Лашкевич К.А., Макеева Д.С., Синицын П.Г., Смирнова В.В., Теренин И.М.
Награды и премии
-
- 2019 Конкурс работ талантливых студентов, аспирантов и молодых ученых МГУ имени М.В.Ломоносова, учрежденного О.В. Дерипаска
- Лауреаты: Анисимова Александра, Акулич К.А., Макеева Десислава Станимировна
- Фонд "Вольное дело", Россия
-
- 2012 Программа «У.М.Н.И.К.» – «Участник молодежного научно-инновационного конкурса»
- Лауреат: Макеева Д.С.
- Фонд содействия развитию малых форм предприятий в научно-технической сфере, Россия
Диссертации
-
- 2019 Функциональные особенности трансляционных факторов eIF2D/TMA64, MCT-1/TMA20 и DENR/TMA22
- Кандидатская диссертация по специальности 03.01.03 - Молекулярная биология (биол. науки)
- Автор: Макеева Д.С.
- Научные руководители: Дмитриев С.Е., к.б.н., МГУ имени М.В. Ломоносова, Шатский И.Н., д.х.н., доц., МГУ имени М.В. Ломоносова
- Защищена в совете МГУ.015.4 МГУ имени М.В. Ломоносова, Биологический факультет
- Оппоненты: Каменский П.А., Гарбер М.Б., Алкалаева Елена Зиновьевна
Руководство курсовыми работами
-
- 2020 Влияние изменённого уровня активности трансляционных факторов eIF2D, MCTS1 и DENR на физиологию эукариотической клетки
- Научные руководители: Дмитриев С.Е., Макеева Д.С.
- Автор: Волынкина Инна Александровна (Специалист)
-
- 2019 Характеристика клеточных линий млекопитающих с изменённым уровнем экспрессии генов eIF2D, MCTS1 и DENR
- Научные руководители: Дмитриев С.Е., Макеева Д.С.
- Автор: Волынкина Инна Александровна (Специалист)
Преподавание учебных курсов
-
- с 1 июля 2013 Практикум по генной инженерии
- МГУ имени М.В. Ломоносова, Факультет биоинженерии и биоинформатики
- обязательная, базовой части, практические занятия, 40 часов
Выступления в СМИ
-
- 24 августа 2018 г. Раскрыт механизм работы связанных с раком и аутизмом белков (indicator.ru)
- Авторы (участники): Макеева Десислава Станимировна, Дмитриев Сергей Евгеньевич